Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес
оригинального документа
: http://kodomo.fbb.msu.ru/~smivic/Projects/1NZJ/size_form.html
Дата изменения: Thu May 21 20:24:11 2009 Дата индексирования: Tue Oct 2 11:15:11 2012 Кодировка: Windows-1251 |
Главная | Проекты | Семестры |
Одноцветное изображение белковой части структуры. |
Белок напоминает лодку (т. к. есть углубление), обросшую болянусами (т. к. поверхность 'лодки' сильно бугристая).
Измерения:
Расстояние между атомами Leu122A.CD2 и His261A.CE1 - R=71.27 ангстрем (больший диаметр).
Растояние между атомами Ile149A.N и Gln80A.NE2 - r=38.66 ангстрем (меньший радиус).
Аппроксимируем белок сферой, радиус которой рассчитаем как rсф=(r + R)/2=54.97 ангстрем =5,5*10-3 мкм. Тогда объем сферы равен =4/3pi(rсф)3= 6.96*10-7 мкм3
Факты, дающие представление об относительных размерах молекулы белка.
Объем молекулы E.coli равен Vcell = pi*r2*h= pi*0,52*2 мкм3=1,57 мкм3
- Сколько молекул белка поместится в одной клетке Escherichia coli, если аппроксимировать клетку цилиндром радиуса 0,5мкм и высоты 2мкм?
Значит, в клетке E.coli поместится Vcell/Vprot =1,57/(6.96*10-7)=2,256*106 молекул белка.
Молекулы одного белка будут занимать Vcell/4400=3,57*10-4 мкм3, такой же объем занимают 3,57*10-4/ Vprot = 512,9 молекул белка.
- Предположим, что все 4400 белков кишечной палочки были синтезированы одновременно и в равных количествах. Предположим, что размеры всех белков одинаковы и равны размерам белка 1NZJ. Предположим, что в клетке ничего нет, кроме белков. Сколькими молекулами будет представлен каждый белок?
Количество молекул белка, помещающихся на линейке длинной l=0,13 мкм: n=l/r=0,13/5,5*10-3=23,64 - примерно 23 молекулы.
- Современные фирмы создают кристаллы CPU с точностью до 0,13 мкм. Сколько молекул белка 1NZJ поместится на линейке такой длины?
Минимальная длина волны видимого света - 0,4 мкм (фиолетовый), следовательно, минимальный различимый объект имеет длину 0,4/2=0,2 мкм, т. е. в длину нужно 'уложить' 0,2/5,5*10-3=36,4 - примерно 37 молекул белка, чтобы они стали видны в световой микроскоп.
- Предел разрешения светового микроскопа оценивается как l/2, где l - длина волны. Сколько молекул белка потребуется, чтобы создать объект, видимый под световым микроскопом?