Новости химической науки > Компьютеры моделируют процесс экспрессии генов

Исследователи из Германии используют комбинацию компьютерной химии и молекулярной биологии для выяснения генетических причин различных заболеваний.

Силке Шперлинг (Silke Sperling) из Института Молекулярной Генетики Макса Планка в Берлине использовала различные методы изучения экспрессии генов. Изучая особенности экспрессии у пациентов, страдающих различными типами сердечнососудистых заболеваний, стало возможным идентифицировать гены, которые могут быть связаны с определенными заболеваниями.

Схема транскрипции сердечных генов демонстрирует взаимоотношение между генами, продуктами их транскрипции и характерными признаками заболевания сердца. (Рисунок из Mol. BioSyst., 2008, DOI: 10.109/b800207j)

Новые данные позволили исследователям отобразить схемы, демонстрирующие то, как продукты экспрессии одних генов влияют на экспрессию других. Главное преимущество нового метода в том, что он позволяет предсказывать взаимодействие факторов транскрипции (белков, регулирующих экспрессию гена) и их мишеней.

Информация, полученная Шперлинг, подтверждает результаты предыдущих биохимических исследований in vitro, демонстрируя надежность такого подхода. Помимо этого исследователи обнаружили еще несколько типов взаимодействий фактор транскрипции - мишень, что доказывает возможность использования метода для изучения генетической предрасположенности к определенному типу заболеваний.

В основном, исследование Шперлинг было продиктовано ее интересом к генетике сердечнососудистых заболеваний, однако она утверждает, что аналогичный подход может быть применен к решению любой медицинской задачи. Явным преимуществом метода является и возможность его использования для переработки больших объемов информации. По словам Шперлинг, надежность метода уже доказана, следующий шаг исследователей - его расширение для изучения всего генома человека.

Источник: Mol. BioSyst., 2008, DOI: 10.109/b800207j

метки статьи: #биохимия, #квантовая химия, #медицинская химия, #молекулярная биология