Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес
оригинального документа
: http://www.library.biophys.msu.ru/MolDyn/monkar0.html
Дата изменения: Sun Oct 10 11:10:10 1999 Дата индексирования: Mon Oct 1 20:09:36 2012 Кодировка: Windows-1251 |
Метод Монте-Карло.
Метод Монте-Карло отличается от метода молекулярной динамики тем, что каждая следующая конформация определяется не путем решения уравнений Ньютона, а с использованием случайных процессов. Вместо оценки сил, определяющих возрастающие атомные движения, при моделировании методом Монте-Карло просто симулируют относительно большие движения системы и определяет, действительно ли измененная структура энергически возможна при моделируемой температуре. Этот метод позволяет перепрыгивать через энергетические барьеры без затрат времени на их преодоление. При этом рассматривается лишь соотношение энергий конформаций до и после скачка. Поскольку метод Монте-Карло сканирует конформационное пространство молекулы без построения настоящей временной "траектории", он не может давать информации о численных временных зависимостях. Однако, метод намного лучше метода молекулярной динамики для расчета термодинамических характеристик молекул, например для расчета спектра возможных конформацие и их энергий.