В начале 90-х годов Институт
антропологии МГУ пережил сложный период в своей истории. Недостаточное
финансирование, связанное с этим полное отсутствие антропологических
экспедиций, отсутствие хоздоговорных исследований потребовало от коллектива
коренной перестройки в своей деятельности. Акцент был сделан на поиск новых
источников финансирования, основными из которых являются гранты РФФИ и РГНФ,
Минвуз. Эти и другие источники позволили существенно улучшить научное
обеспечение новой техникой и оборудованием. В настоящее время исследования
ведутся по нескольким научным направлениям, включая самые современные
(экологическая антропология, популяционная и эволюционная генетика).