Педагогическую деятельность Н.Н. Черногор начал в июле 1994 г. в качестве преподавателя кафедры государственно-правовых дисциплин  Омского юридического института МВД России. В октябре этого же года поступил в очную адъюнктуру Академии управления МВД России, где продолжил преподавательскую деятельность на кафедре государственно-правовых дисциплин.

После окончания очной адъюнктуры Академии управления МВД России и успешной защиты кандидатской диссертации в 1999 г. вернулся в Омск и работал преподавателем кафедры государственно-правовых дисциплин Омского юридического института МВД России. С 2000 г. по 2001 г. преподавал на кафедре государственно-правовых дисциплин Тюменского юридического института МВД России, .

С 2001 г. по 2008 г. занимал должности доцента кафедры государственно-правовых дисциплин Московской академии предпринимательства при Правительстве г. Москвы.

С 2008 г. по 2010 г. работал в Институте законодательства и сравнительного правоведения при Правительстве Российской Федерации, ведущим научным сотрудником отдела мониторинга законодательства, исполнял обязанности заведующего отделом, совмещая с преподаванием в Международном юридическом институте.