Программа . ... Непригодна для поиска сколько-нибудь удаленных гомологов . ... Про программы пакета BLAST и их установку на своем компьютере читайте здесь . ... Программа formatdb создает в текущей директории три файла с расширениями nhr, nin и nsq; первая часть имен этих трех файлов одинаковая, это и есть "Base name for BLAST files". ... blastp, blastn и т.д., строчными буквами!), -d (базовое имя индексных файлов), -i (входной файл), -o (выходной файл), и, возможно, -e (см. также BLAST help ). ...