Поиск по: -
Поискать по всем серверам
На этой странице приведены все страницы, которые ссылаются на http://kodomo.cmm.msu.ru/~darkhan/projects/model/biomol/posre.itp. Показаны документы 1 - 1 из 1.
1. Айдарханов Руслан ФББ - Молекулярная динамика биологических молекул в GROMACS
... Даны файлы: . ... Файл с ячейкой уравновешеных молекул формамида, fam_em.gro . ... файл параметров для молекулярной динамики md.mdp . ... Построим файл топологии системы в силовом поле amber99sb и файл с координатами в формате Gromacs. pdb2gmx -f 2xl1.pdb -o pep -p pep -ff amber99sb -water tip3p . ... Добавим в ячейку молекулы формамида. genbox -cp pep_em -p pep -cs fam_em.gro -o pep_s В выводе программы указано, что добавленно 892 молекулы формамида. ... Копируем файлы: . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.cmm.msu.ru/~darkhan/projects/model/biomol.html -- 12.8 Кб -- 18.05.2011
Похожие документы
Похожие документы