XWare Поиск по информационным ресурсам МГУ English Russian
       
       Точная форма слов   О проекте   Сайты   Помощь
Поиск по:   - Поискать по всем серверам
На этой странице приведены все страницы, которые ссылаются на http://kodomo.cmm.msu.ru/~golikov_v/md/pr.mdp. Показаны документы 1 - 1 из 1.

1. Молекулярная динамика биологических молекул в GROMACS
Даны файлы: . ... файл-заготовка тополгии системы b.top ; . ... файл параметров для молекулярной динамики md.mdp . ... Длина траектории - 50нс . ... Визуальный анализ движения молекул. trjconv -f b_md.xtc -s b_md.tpr -o b_pbc_1.pdb -skip 20 b_pbc_1.pdb . ... Получим размеры ячейки из траектории. g_traj -f b_md.xtc -s b_md.tpr -ob box_1.xvg В файле box_1.xvg содержатся размеры ячейки. ... Запустим анализ для конца траектории g_order -s b_md -f b_md.xtc -o ord_end.xvg -n sn1.ndx -b 45000 -d P . ...
[ Сохраненная копия ]  Ссылки http://kodomo.cmm.msu.ru/~golikov_v/67.html -- 7.6 Кб -- 29.05.2011
Похожие документы


Астронет | Научная сеть | ГАИШ МГУ | Поиск по МГУ | О проекте | Авторам

Комментарии, вопросы? Пишите: info@astronet.ru или сюда

Rambler's Top100 RFBR Яндекс цитирования