Пакет программ Gromacs предоставляет много инструментов для анализа траекторий и свойств динамики. ... Результаты анализа выдаваемые GROMACS имеют расширение xvg ( программа GRACE), но формат самих файлов текстовой, так что построение графиков можно делать в gnuplot или excel. ... Алгоритм расчета электростатики coulombtype = Cut-off. ... АНАЛИЗ ФАЙЛОВ: . ... Определим изменение гидрофобной и гидрофильной поверхности в ходе самосборки: g_sas -f b_md.xtc -s b_md.tpr -o sas_b.xvg Полученный файл . ...