Поиск по: -
Поискать по всем серверам
На этой странице приведены все страницы, которые ссылаются на http://kodomo.fbb.msu.ru/FBB/year_04/doc/BLAST_help/megablast.html. Показаны документы 1 - 2 из 2.
1. Help to practice 4 (MEGABLAST)
Скопируйте в рабочую директорию файл с аннотированным геномом E.coli (Р:/y05/Term3/ecoli.embl). С помощью команды grep найдите в этой записи строчки, в которых одновременно, но не подряд, встречаются слово codon и название нужной аминокислоты, перенаправьте вывод в файл. ... Подсказка: программа понимает спецсимволы . ... Выберите среди полученных строчек подходящую и проведите текстовой поиск этой строки в файле ecoli.embl. ... Поиск с помощью MegaBLAST и discontiguous MegaBLAST . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/FBB/year_05/term3/help4.html -- 8.1 Кб -- 26.09.2006
Похожие документы
Похожие документы
2. Task 9 (EMBL )
... Создайте в своей директории файл с записью D89965 банка EMBL. ... В файле P:\y07\Term3\EMBL\trna_ecoli.fasta лежат последовательности всех тРНК, проаннотированных в полном геноме E.coli K12. ... Просмотрите выходной файл. ... Вырежьте гомологичный участок в отдельный файл командой seqret -sask (будьте внимательны, следите за направлением найденной последовательности относительно записи EMBL - оно может быть прямым либо обратным, и это можно узнать, глядя на выдачу BLAST!) ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.cmm.msu.su/FBB/year_07/term3/task9.html -- 7.4 Кб -- 28.10.2008
[ Сохраненная копия ] Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/FBB/year_07/term3/task9.html -- 7.4 Кб -- 28.10.2008
[ Сохраненная копия ] Ссылки http://kodomo.cmm.msu.ru/FBB/year_07/term3/task9.html -- 7.4 Кб -- 28.10.2008
Похожие документы
[ Сохраненная копия ] Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/FBB/year_07/term3/task9.html -- 7.4 Кб -- 28.10.2008
[ Сохраненная копия ] Ссылки http://kodomo.cmm.msu.ru/FBB/year_07/term3/task9.html -- 7.4 Кб -- 28.10.2008
Похожие документы