... Для каждого задания указаны формат отчета и число баллов за минимально приемлемое выполнение + число бонусных баллов за высокое качество работы. Задание 1. Сравнить разные способы оценки эволюционных расстояний между нуклеотидными последовательностями. ... Получите мутантные последовательности с помощью программы msbar пакета EMBOSS, синтаксис: msbar <infile> <outfile> -point 4 -count <общее количество замен> -auto Не забудьте пересчитать число замен на полную длину гена!! ...
... Программа PAL2NAL позволяет из множественного выравнивания белков и соотв. ДНК (или мРНК)-последовательности создать выравнивание нуклеотидных последовательностей, разделенных на кодоны. ... Соответствующие гены (без выравнивания!!) сохранены в файле ( G1.fasta ). ... Последовательности генов сохранены в файле G2.fasta , а попарное выравнивание соответствующих белков в файле Р2.aln . ... Выравнивание белков оплодотворения - P2.aln ( вот в формате msf ). + файлы, содержащие гены: . G1.fasta ; . ...