... Сведения о работе с Gnuplot см. здесь . ... Сегодня мы будем изучать как реализован контроль температуры в молекулярной динамике на примере GROMACS. ... Начнем с того, что подготовим файл координат и файл топологии. ... be.mdp - метод Берендсена для контроля температуры. vr.mdp - метод "Velocity rescale" для контроля температуры. nh.mdp - метод Нуза-Хувера для контроля температуры. an.mdp - метод Андерсена для контроля температуры. sd.mdp - метод стохастической молекулярной динамики. ...
... Уроки по работе с GROMACS находятся здесь. ... Цель : изучить как реализован контроль температуры в молекулярной динамике на примере GROMACS. ... Для начала подготовим файл координат и файл топологии. ... be.mdp - метод Берендсена для контроля температуры. vr.mdp - метод "Velocity rescale" для контроля температуры. nh.mdp - метод Нуза-Хувера для контроля температуры. an.mdp - метод Андерсена для контроля температуры. sd.mdp - метод стохастической молекулярной динамики. ...