... С помощью программы ClastalW построено выравнивание последовательности из структуры ID: 1lmp и предложенного белка LYS_BPPHV ( UniProt ), в качестве формата выходного файла был сразу указан PIR: . ... После имени последовательности моделируемого белка надо добавить строчку: . ... HETATM 1014 O7 NAG 130 . HETATM 1014 O7A NAG 130 . ... что имя файла с выравниванием и имена последовательностей образца и моделируемого белка, строчка 13 (а имя файла со структурой содержится в выравнивании); . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>10185) - kodomo.cmm.msu.ru/ )

• Гомологичное моделирование комплекса белка с лигандом
• Айдарханов Руслан ФББ - Гомологичное моделирование комплекса белка с лигандом
• Страничка шестого семестра Журавлевой Кати

Задание 1: моделирование структуры белка по гомологии. ... Модификация файла со структурой: удалите всю воду из структуры (в текстовом редакторе) всем атомам лиганда присвойте один и тот же номер "остатка" (MODELLER считает, что один лиганд = один остаток) и модифицируйте имена атомов каждого остатка, добавив в конец буквы A, B, C. Смысл операции в том, что атомы остатка 130 имели индекс А, атомы остатка 131 имели индекс В и т.д. Пример: |Было: |Стало | ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>38304) - dualopt1.cmm.msu.ru/ )

... Вы будете работать с белком лизоцимом из указанного организма. ... Модификация файла со структурой: удалите всю воду из структуры (в текстовом редакторе) всем атомам лиганда присвойте один и тот же номер "остатка" (MODELLER считает, что один лиганд = один остаток) и модифицируйте имена атомов каждого остатка, добавив в конец буквы A, B, C. Смысл операции в том, что атомы остатка 130 имели индекс А, атомы остатка 131 имели индекс В и т.д. После модификации имен атомов измените номера остатков на 130....

Еще в разделе: (Показать все результаты (>29148) - kodomo.fbb.msu.ru/ )

• Гомологичное моделирование - учебный сайт Смирновой Виктории

SAVE_PHOTO_WHEN_TERMINATE=T, CREATE_PRE_MAIN_SEQUENCE_MODEL=T, PRE_MS_RELAX_NUM_STEPS= 200, LOAD_SAVED_MODEL=F, SAVED_MODEL_NAME=' undefined ', CREATE_INITIAL_MODEL=F, INITIAL_MODEL_RELAX_NUM_STEPS= 10, INITIAL_MODEL_EPS= 5.0000000745058060E-002, RADIUS_IN_CM_FOR_CREATE_INITIAL_MODEL= 0.0000000000000000 , MASS_IN_GM_FOR_CREATE_INITIAL_MODEL= 0.0000000000000000 , STEPS_TO_TAKE_BEFORE_TERMINATE= -1, STOP_IF_THIS_FILE_EXISTS=' ', SET_INITIAL_AGE=F, INITIAL_AGE= ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>1171) - crydee.sai.msu.ru/ )

• http://crydee.sai.msu.ru/ftproot/pub/MESA-models/M9_Z002/star_job_namelist.out
• Long description for example showing how structurally overlapping cells are

The quantitative probabilistic model of the solar energetic particle fluxes description . ... Notice : Undefined index : ion_spectra in / home / swx / public_html / models / database / modules / prog2.php on line 158 Notice : Undefined index : MNX in / home / swx / public_html / models / database / modules / prog2.php on line 159 Notice : Undefined index : NPB in / home / swx / public_html / models / database / modules / prog2.php on ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>1337) - swx.sinp.msu.ru/ )

• http://swx.sinp.msu.ru/models/database/modules/prog.php
• http://swx.sinp.msu.ru/models/database/modules/smdc-prog.php
• http://swx.sinp.msu.ru/models/get_charea.php

extra:model:main ]] . CompHEP . ... Please address any questions concerning models to their authors. Authors of a model keep all rights. Any CompHEP user may apply a model respecting conditions defined by the authors. ... Model ==== ** Model description ** * Name: modelname * Author: modelauthor * Short description: * Long description: see [[http://www.univ.com/author/auth|modelauthor]] * {{http://comphep.sinp.msu.ru/extra/model/auth.zip|auth.zip}}, 123KB * References: - ref 1 - ref 2 .. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>90) - comphep.sinp.msu.ru/ )

Электронная библиотека Попечительского совета . ... Klas W., Schrefl M. - Metaclasses and Their Application: Data Model Tailoring and Database Integration . ... Название: Metaclasses and Their Application: Data Model Tailoring and Database Integration . ... By introducing the basic concepts of the open object-oriented database management system VODAK, it demonstrates how the extended metaclass concept can be integrated homogeneously into object-oriented data models. ... Class, METACLASS 65-69 . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>20834) - lib.mexmat.ru/ )

• Schmidt M. (ed.) - Polyelectrolytes with Defined Molecular Architecture II ::
• Crowell B. - Electricity and Magnetism :: Электронная библиотека
• Engstrom H.T. - Periodicity in Sequences Defined by Linear Recurrence Relations

. "Transaction modeling on architectural level of software design" . K.V. Akhtyrtchenko . Transaction modeling on architectural level of software design is considered. Transaction structure of software is defined. A method for describing the transaction structure with UML is proposed. The relationship between the transaction structure and other structures of architectural level design is specified. PDF (in Russian) (3.77MB) . PostScript. zip (in Russian) (4.71MB) . PDF. zip (in Russian) (2.92MB) .

Еще в разделе: (Показать все результаты (>417) - num-meth.srcc.msu.ru/ )

• "Optimal Gaussian approximation in the Ising model"
• "An algorithm of high performance modeling of optical nanocoating deposition

... Phys. A25 (2010) 3933 (arXiv:0908.0457 [hep-ph]) A brief reminder AdS/CFT correspondence ґ the conjectured equivalence between a string theory defined on one space and a CFT without gravity defined on conformal boundary of this space. ... At one imposes certain gauge invariant boundary conditions on the fields. Equation of motion for the scalar field Solution independent of usual 4 space-time coordinates where M is identified with the quark mass matrix and with the condensate. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>191) - qfthep.sinp.msu.ru/ )

• http://qfthep.sinp.msu.ru/talks2015/Degt.pdf
• http://qfthep.sinp.msu.ru/talks2015/1435342231_Egorov%20-%20Higgs%20field%20as%20the%20Goldberger-Wise%20field%20-%20QFTHEP2015.pdf

AFML . AFML (The Advanced Feature-based Modeling Language) is a language defined to model the structural and semantic aspects of real world objects such as furnitures and buildings. ... AFML is a rendering independent VR modeling language for which shaders and ray-tracers are available. ... It can be mapped to both the COBRA -based AFML and the C++-based EGR GF -API in a consistent manner. ... Available Binary Packages: . ... SAL Home | Computer Graphics, Images Signals | Misc . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>1635) - www.sai.msu.su/ )

• SAL- Computer Graphics, Images Signals - Modelers - MSDL
• SAL- Other Scientific Fields - Electrical Related Software - SLS
• A Kernel Model for Precision Timekeeping

Next: Getting started with LanHEP Up: The LanHEP Handbook Previous: The LanHEP Handbook Contents . ... LanHEP makes possible the generation of Feynman rules for propagators and vertices in momentum representation starting from the Lagrangian defined by a user in some simple format very similar to canonical coordinate representation. The user should prepare a text file with description of all Lagrangian terms in the format close to the form used in standard publications. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>1340) - theory.sinp.msu.ru/ )

• Structure of LanHEP input file
• Simplifying the expression for vertices
• Getting started with LanHEP

... Tear faults . ... Tectonic . ... Tectonic, collision, (see collisional tectonics) . ... Tectonic, extensional. (see extensional tectonics) . ... Tectonic, plate (see Plate tectonics) . ... Tectonic, regional, (see regional geology) . ... Tectonic, stress . ... Tensor, stress See Stress tensor . ... Thrust faults, in fold-thrust belts, (see fold-thrust belts) . ... Thrust sheet . ... Thrust-fault systems, fold-thrust belts, (see fold-thrust belts) . ... Transform faults, See also Strike slip faults ....

Еще в разделе: (Показать все результаты (>10907) - geo.web.ru/ )

• Dictionary_M
• Dictionary_R
• Dictionary_P

grdtrend - Fit and/or remove a polynomial trend in a grd file grdtrend grdfile -N n _ model [ r ] [ -D diff . grd ] [ -T trend . ... grd ] grdtrend reads a 2-D gridded file and fits a low-order polynomial trend to these data by [optionally weighted] least-squares. ... Optionally, append r to the -N option to perform a robust fit. ... N n _ model [ r ] sets the number of model parameters to fit. Append r for robust fit. ... D Write the difference (input data - trend) to the file diff . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>695) - xray.sai.msu.ru/ )

• Galactic Gravitational Wave Background
• Initial parameters of compact stars
• Calculation of Evolutionary Tracks

... The <P> element is used to define a paragraph. ... The ALIGN attribute can be used to explicitly specify the horizontal alignment. ... Note: Do not use empty paragraphs to add white space around headings, lists or other elements. ... By convention, the class names are interpreted hierarchically, with the most general class on the left and the most specific on the right, where classes are separated by a period. ... You can then explicitly specify line breaks in paragraphs using the BR element. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>159) - comet.sai.msu.ru/ )

• Horizontal Tabs
• Banners
• Hypertext Links

... The Millennium that Defined Earth . ... The Earth started as the center of everything , but became a planet placed in the Solar System , which became placed in a Galaxy , which became placed in the Local Group of Galaxies , which became placed in an expanse so vast we call it just the Universe . ... Публикации с ключевыми словами: Earth - Y2K - millennium - структура Вселенной - Система мира Птолемея - Система мира Коперника - геоцентрическая система Мира . ... Земля в сумерках . Восход Земли . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>33128) - www.astronet.ru/ )

• Астронет > The Millennium that Defines Universe
• The Millennium that Defined Earth
• The Century that Defined Galaxy

... Model , Rus. ... Analysis and Math.Modelling , Russian J. Numerical Anal. ... Modelling , Russian Journal Numerical Analysis and Mathematical Modelling . ... Kobelkov G.M. , Zvyagin A.V. в журнале Russian Journal of Numerical Analysis and Mathematical Modelling , издательство V S P (Netherlands) , том 30, ? ... Tretyakova Rufina M. , Andreas Meyerhans, Bocharov Gennady A. в журнале Russian Journal of Numerical Analysis and Mathematical Modelling , издательство V S P (Netherlands) , том 30, ? ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>26029) - istina.msu.ru/ )

• Computational Mathematics and Modeling - журнал | ИСТИНА - Интеллектуальная
• Journal of Chemical Information and Modeling - журнал | ИСТИНА -
• Mathematical modelling of natural phenomena - журнал | ИСТИНА -

Network Working Group X. Liu Internet-Draft Ericsson Intended status: Standards Track I. Bryskin Expires: September 20, 2016 Huawei Technologies V. Beeram Juniper Networks T. Saad Cisco Systems Inc H. Shah Ciena O. Gonzalez de Dios Telefonica March 20, 2016 A YANG Data Model for Configuration Scheduling draft-liu-netmod-yang-schedule-00 Abstract This document describes a data model grouping for configuration scheduling. ... Liu, et al. ... Configuration Scheduling YANG Data Model Overview.. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>17867) - mirror.msu.net/ )

• http://mirror.msu.net/pub/rfc-editor/rfc-ed-all/mibs/private.mibs/twg.txt
• http://mirror.msu.net/pub/rfc-editor/internet-drafts/draft-zheng-intarea-gre-yang-01.txt
• http://mirror.msu.net/pub/rfc-editor/internet-drafts/draft-lear-ietf-netmod-acl-dnsname-00.txt

INFORMATION MEASURE OF THE CORPORATE FINANCIAL INDICATORS T.V. Ryzhkova Plekhanov Russian University of Economics, 36 Stremjanni per., ... The corporate financial system consists of structured elements subsets of financial coefficients. The financial system division into two subsystems is defined. ... For the subset of the corporate financial coefficients a discreet information measure well known as the Shannon entropy for the multivariate random vector is used. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>547) - www.mce.biophys.msu.ru/ )

• http://www.mce.biophys.msu.ru/archive/doc98332/eng.pdf
• http://www.mce.biophys.msu.ru/archive/doc32738/doc.pdf
• http://www.mce.biophys.msu.ru/archive/doc61424/eng.pdf

... Vestnik Moskovskogo Universiteta. Seriya 1. Matematika. Mekhanika. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>274) - vestnik.math.msu.su/ )

• Vestnik Moskovskogo Universiteta. Seriya 1. Matematika. Mekhanika N 2/2012

... Defined Constants for C and Fortran . ... assorted constants (both C and Fortran) */ MPI_BOTTOM MPI_PROC_NULL MPI_ANY_SOURCE MPI_ANY_TAG MPI_UNDEFINED MPI_BSEND_OVERHEAD MPI_KEYVAL_INVALID . ... elementary datatypes (C) */ MPI_CHAR MPI_SHORT MPI_INT MPI_LONG MPI_UNSIGNED_CHAR MPI_UNSIGNED_SHORT MPI_UNSIGNED MPI_UNSIGNED_LONG MPI_FLOAT MPI_DOUBLE MPI_LONG_DOUBLE MPI_BYTE MPI_PACKED . ... datatypes for reduction functions (Fortran) */ MPI_2REAL MPI_2DOUBLE_PRECISION MPI_2INTEGER . ... Центры . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>511) - www.parallel.ru/ )

• Defined Constants | PARALLEL.RU - Информационно-аналитический центр по
• Defined Constants, Error Codes, Info Keys, and Info Values | PARALLEL.RU -
• User-Defined Operations | PARALLEL.RU - Информационно-аналитический центр по