Алексеевский Андрей Владимирович . ... Миронов Андрей Александрович . ... Тем не менее, посещение страницы "Тьюторы ФББ" может быть полезным для выбора тьютора . ... Для студентов 1-го курса: Можно начать поиски тьютора уже сейчас! ... Активность в выборе темы и руководителя - за студентом. Студент выбирает руководителя и тему, просит руководителя взять его на данную тему. ... Студент сообщает о договоренности (фамилии студента и тьютора, название темы) Л.А.Зиновкиной . ...
Надо поместить в рабочую директорию PDB-файл (пусть это будет 1XYZ.pdb ) и выполнить на kodomo команду: dsspcmbi 1XYZ.pdb 1XYZ.dssp Альтернативный вариант (и единственный, пока DSSP не установлен на kodomo) скачать уже готовый результат по FTP с ftp://ftp.cmbi.ru.nl//pub/molbio/data/dssp/. Выходной файл (в данном случае 1XYZ.dssp) лучше всего импортировать в Excel. ... Как этим воспользоваться, читайте в подсказках к предыдущему заданию и всевозможных online-help'ах. ...
Создайте рабочую директорию на диске E: типа Ivanov/md . Вам даны файлы: . ... Построим файл топологии системы в силовом поле amber99sb и файл с координатами в формате Gromacs. pdb2gmx -f dna.pdb -o dna -p dna -ff amber99sb -water tip3p . ... Проведем оптимизацию геометрии системы, что бы удалить "плохие" контакты в молекуле. grompp -f em -c dna_ec -p dna -o dna_em -maxwarn 1 mdrun -deffnm dna_em -v Отметье в отчете изменение максимальной силы в ходе оптимизации геометрии. ...
hpc@cmc . Высокопроизводительные вычисления на ВМК МГУ . Blue Gene/P . ... Регистрация . ... Серия Blue Gene в мире . ... Доступ по SSH . ... Регламент доступа . ... С 2008 года на факультете ВМК МГУ имени М. В. Ломоносова работает суперкомпьютер IBM Blue Gene/P, который является одной из первых систем данной серии среди установленных в мире. Архитектура Blue Gene была предложена компанией IBM в рамках проекта по исследованию возможностей достижения новых рубежей в супервычислениях. ...
This page serves as a trampoline to various popular places in my archive. The name "shortcuts" does not bear any relation to Windoze 95 shortcuts. ... NFTP -- ftp client for OS/2, Windows, Linux, FreeBSD, Solaris . Mozilla, i.e. free version of Netscape Navigator . ... LEO mirror (1.07GB) . Hobbes mirror (excluded are /pub/java and /pub/multimedia) (1.68GB) . ... SAI archive (650MB) . ... Copy of University of Wisconsin-Parkside lyrics archive (the original site is now closed) . ...
... Apache HTTP Server Version 2.0 . Apache > HTTP Server > Documentation > Version 2.0 > Programs . ... ab is a tool for benchmarking your Apache Hypertext Transfer Protocol (HTTP) server. ... This especially shows you how many requests per second your Apache installation is capable of serving. ... The default is to just perform a single request which usually leads to non-representative benchmarking results. -p POST-file . ... Use a proxy server for the requests. -y <tr>-attributes . ...
О лаборатории . ... Лаборатория теоретической биофизики . ... For lipid bilayer modelling the whole toolchain was built: from creating membranes to MD trajectory analysis. ... We use OPLS-AA with some includings; ?includings? are overlays on the standart GROMACS forcefield files. ... 4 комментариев " Lipid membrane MD modeling with GROMACS " . Python membrane generator for MD simulations ERG Research Group: Лаборатория теоретической биофизики написал (Февраль 14th, 2012 4:11 пп) . ...
... Linux, возможно, является наиболее значительным достижением в области свободно распространяемых программ со времен Space War, или более позднего Emacs. ... Linux (произносится "лИнукс") принадлежит семейству UNIX-подобных операционных систем, которая может работать на компьютерах Intel 80386 и 80486. ... Введение в системное администрирование Linux. ... Большинство свободно распространяемых по сети Internet программ для UNIX может быть откомпилировано для LINUX практически без особых изменений. ...
... Начальный каталог пользователя и команда ls. Что там за файлы, понятие скрытых файлов. ... Тур по файловой системе с объяснением основных команд (/bin, команды ps и др.), устройств (/dev), настроек (/etc), основ монтирования (/mnt, команды mount и umount), временных файлов, служебных команд, строения каталогов /home (и /etc/skel), /usr, /usr/local, /var. ... Типы файлов: обычные, каталоги, символические ссылки; их отражение по команде ls -F. Команда file и ее смысл. ... Поиск файлов командой find. ...
Список бесплатного программного обеспечения, которое может заменить лицензионные коммерческие пакеты . ... Полностью русифицирован, поддерживает все файлы форматов Microsoft Office. (версия 3.3 для Windows, размер 147 Мб, загрузить ) . ... Texnic Center - бесплатная оболочка для работы с TeX, аналог коммерческого пакета WinEdt. (версия 1.0 для Windows, 4.6 Мб загрузить ). TexMaker - бесплатная оболочка для работы с TeX, аналог коммерческого пакета WinEdt. (версия 3.3.4 для Windows, загрузить ). ...
Предлагаемая примерная программа по курсу "Компьютерных методов в физике" соответствует физическим естественнонаучным направлениям бакалавриата. ... Поэтому предпочтительным является четырехсеместровый курс "Компьютерных методов в физике", основу которого составляют семинарские и практические занятия. ... В соответствии с программой курса студент должен: . ... Назначение лекционного блока курса - дать слушателям обзор применения современных компьютеров и компьютерных методов в физике. ...
... Solver is implemented in CUDA Numerical Simulation of the Ice Moving in Strati ed Fluid PhD Degree Obtained in 2013 By using GPU we are able to perform computations with higher resolution which gives us an opportunity to study the interaction between sea ice and ocean in greater details Evgeny Mortikov, MSU Research Computing Center , researcher, evgeny.mortikov@gmail.com The project aims at determining the relevance of ocean strati cation for ...
The Future of GPU Computing Wen-mei Hwu University of Illinois, Urbana-Champaign Agenda · · · · Setting the Context Current Victories Coming Battles Conclusion and Outlook NVIDIA HPC Day Moscow State University 2012 CPUs: Latency Oriented Design · Large caches Convert long latency memory accesses to short latency cache accesses ALU Control ALU ALU · Sophisticated control Branch prediction for reduced branch latency ... NVIDIA HPC Day Moscow State University 2012 ...
[
Текст
]
Ссылки http://ccoe.msu.ru/sites/default/files/presentations/Moscow-Keynote-Hwu-10-22-2012.pdf -- 1614.3 Кб -- 25.10.2012 Похожие документы