... alignment_blocks method added to homology and tested. ... 1.1 --- a/ allpy /homology.py Wed Jul 06 18:05:51 2011 +0400 1.2 +++ b/ allpy /homology.py Thu Jul 07 12:53:42 2011 +0400 1.3 @@ -1,3 +1,5 @@ 1.4 +from allpy import protein 1.5 + 1.6 class MonomerHomology(object): 1.7 Essentially, alignment is a set of monomer homology classes 1.8 Object of type MonomerHomology desribes an alignment in terms of monomer homology 1.9 @@ -10,12 +12,23 @@ 1.10 1.11 DATA: 1.12 monomer_ids = {monomer_id...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>713) - kodomo.fbb.msu.ru/ )

• allpy: 0e41dc9c60bc
• allpy: fd3481013cd5

... Markup We sometimes (very often) want to add marks on an alignment. ... Our definitions Examples What works Projects using allpy Future Converting alignment format alignment = protein. Alignment ().append_file( input_file, format= genbank ) alignment .to_file(output_file, format= fasta ) Converting alignment format -- the uncensored version from allpy import protein input_file = open( input_file.fasta ) output_file = open( output_file.fasta , w ) alignment = protein ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>3) - kodomo.cmm.msu.ru/ )

... Изображения. ... IMAGE: READ/IMAGE, WRITE/IMAGE, COMPUTE/IMAGE, COPY/II .. ... версии 98NOV с кратким описанием того, что данная команда выполняет. asload  назначение дисплейного окна и визуализация в нем изображения ; areatable  построение таблицы, содержащей определение областей заданного разме- ра, равномерно покрывающих заданное изображение; 95 autocuts  определение хороших уровней для визуализации изображения ; buildcube  построение куба данных из заданного набора двумерных ...