... Вы будете работать с белком лизоцимом из указанного организма. ... Модификация файла со структурой: удалите всю воду из структуры (в текстовом редакторе) всем атомам лиганда присвойте один и тот же номер "остатка" (MODELLER считает, что один лиганд = один остаток) и модифицируйте имена атомов каждого остатка, добавив в конец буквы A, B, C. Смысл операции в том, что атомы остатка 130 имели индекс А, атомы остатка 131 имели индекс В и т.д. После модификации имен атомов измените номера остатков на 130....

Еще в разделе: (Показать все результаты (>29202) - kodomo.fbb.msu.ru/ )

• Гомологичное моделирование - учебный сайт Смирновой Виктории

Задание 1: моделирование структуры белка по гомологии. ... Модификация файла со структурой: удалите всю воду из структуры (в текстовом редакторе) всем атомам лиганда присвойте один и тот же номер "остатка" (MODELLER считает, что один лиганд = один остаток) и модифицируйте имена атомов каждого остатка, добавив в конец буквы A, B, C. Смысл операции в том, что атомы остатка 130 имели индекс А, атомы остатка 131 имели индекс В и т.д. Пример: |Было: |Стало | ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>38405) - dualopt1.cmm.msu.ru/ )

... На страницу шестого семестра . ... В исходнике имеются взаимодействия следующих атомов: / 1LMP //A/TRP`63/NE1 / 1LMP //A/ NAG `131/O3 / 1LMP //A/ NAG `131/O7 / 1LMP //A/ASN`59/N / 1LMP //A/ASP`52/OD2 / 1LMP //A/NDG`132/O1L / 1LMP //A/NDG`132/C1 / 1LMP //A/NDG`132/O / 1LMP //A/NDG`132/O1L / 1LMP //A/ASN`46/OD1 / 1LMP //A/VAL`109/N / 1LMP //A/NDG`132/O6 / 1LMP //A/GLU`35/OE2 / 1LMP //A/ NAG `131/N2 / 1LMP //A/ALA`107/O / 1LMP //A/ NAG `130/O7 / ... 1lmp . ... RMS Z-score for bond lengths: 0.839 . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>10323) - kodomo.cmm.msu.ru/ )

• Гомологичное моделирование комплекса белка с лигандом.
• Гомологичное моделирование комплекса белка с лигандом
• model_lig

SAVE_PHOTO_WHEN_TERMINATE=T, CREATE_PRE_MAIN_SEQUENCE_MODEL=T, PRE_MS_RELAX_NUM_STEPS= 200, LOAD_SAVED_MODEL=F, SAVED_MODEL_NAME=' undefined ', CREATE_INITIAL_MODEL=F, INITIAL_MODEL_RELAX_NUM_STEPS= 10, INITIAL_MODEL_EPS= 5.0000000745058060E-002, RADIUS_IN_CM_FOR_CREATE_INITIAL_MODEL= 0.0000000000000000 , MASS_IN_GM_FOR_CREATE_INITIAL_MODEL= 0.0000000000000000 , STEPS_TO_TAKE_BEFORE_TERMINATE= -1, STOP_IF_THIS_FILE_EXISTS=' ', SET_INITIAL_AGE=F, INITIAL_AGE= ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>1199) - crydee.sai.msu.ru/ )

• http://crydee.sai.msu.ru/ftproot/pub/MESA-models/M9_Z002/star_job_namelist.out
• Long description for example showing how structurally overlapping cells are

The quantitative probabilistic model of the solar energetic particle fluxes description . ... Notice : Undefined index : ion_spectra in / home / swx / public_html / models / database / modules / prog2.php on line 158 Notice : Undefined index : MNX in / home / swx / public_html / models / database / modules / prog2.php on line 159 Notice : Undefined index : NPB in / home / swx / public_html / models / database / modules / prog2.php on ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>1343) - swx.sinp.msu.ru/ )

• http://swx.sinp.msu.ru/models/database/modules/prog.php
• http://swx.sinp.msu.ru/models/database/modules/smdc-prog.php
• http://swx.sinp.msu.ru/models/get_charea.php

extra:model:main ]] . CompHEP . ... Please address any questions concerning models to their authors. Authors of a model keep all rights. Any CompHEP user may apply a model respecting conditions defined by the authors. ... Model ==== ** Model description ** * Name: modelname * Author: modelauthor * Short description: * Long description: see [[http://www.univ.com/author/auth|modelauthor]] * {{http://comphep.sinp.msu.ru/extra/model/auth.zip|auth.zip}}, 123KB * References: - ref 1 - ref 2 .. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>90) - comphep.sinp.msu.ru/ )

Электронная библиотека Попечительского совета . ... Klas W., Schrefl M. - Metaclasses and Their Application: Data Model Tailoring and Database Integration . ... Название: Metaclasses and Their Application: Data Model Tailoring and Database Integration . ... By introducing the basic concepts of the open object-oriented database management system VODAK, it demonstrates how the extended metaclass concept can be integrated homogeneously into object-oriented data models. ... Class, METACLASS 65-69 . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>24103) - lib.mexmat.ru/ )

• Schmidt M. (ed.) - Polyelectrolytes with Defined Molecular Architecture II ::
• Crowell B. - Electricity and Magnetism :: Электронная библиотека
• Wilcox D. - Turbulence modeling for CFD :: Электронная библиотека

. "Transaction modeling on architectural level of software design" . K.V. Akhtyrtchenko . Transaction modeling on architectural level of software design is considered. Transaction structure of software is defined. A method for describing the transaction structure with UML is proposed. The relationship between the transaction structure and other structures of architectural level design is specified. PDF (in Russian) (3.77MB) . PostScript. zip (in Russian) (4.71MB) . PDF. zip (in Russian) (2.92MB) .

Еще в разделе: (Показать все результаты (>504) - num-meth.srcc.msu.ru/ )

• "Optimal Gaussian approximation in the Ising model"
• "An algorithm of high performance modeling of optical nanocoating deposition

... Physics Department . ... The structure model of a cubic aperiodic phase ('quasicrystal without forbidden symmetry axes') // J. Phys.: Cond. ... Model for the transformation of an icosahedral phase into a B2 crystalline phase // J. Phys. Cond. ... Seminar of the Polymer Council of RAS . Seminar in Polymer Physics . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>379) - polly.phys.msu.ru/ )

• Березкин: избранные публикации
• Группа симметрийных исследований и моделирования (био)полимеров - Кафедра

... Phys. A25 (2010) 3933 (arXiv:0908.0457 [hep-ph]) A brief reminder AdS/CFT correspondence ґ the conjectured equivalence between a string theory defined on one space and a CFT without gravity defined on conformal boundary of this space. ... At one imposes certain gauge invariant boundary conditions on the fields. Equation of motion for the scalar field Solution independent of usual 4 space-time coordinates where M is identified with the quark mass matrix and with the condensate. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>191) - qfthep.sinp.msu.ru/ )

• http://qfthep.sinp.msu.ru/talks2015/Degt.pdf
• http://qfthep.sinp.msu.ru/talks2015/1435342231_Egorov%20-%20Higgs%20field%20as%20the%20Goldberger-Wise%20field%20-%20QFTHEP2015.pdf

AFML . AFML (The Advanced Feature-based Modeling Language) is a language defined to model the structural and semantic aspects of real world objects such as furnitures and buildings. ... AFML is a rendering independent VR modeling language for which shaders and ray-tracers are available. ... It can be mapped to both the COBRA -based AFML and the C++-based EGR GF -API in a consistent manner. ... Available Binary Packages: . ... SAL Home | Computer Graphics, Images Signals | Misc . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>1677) - www.sai.msu.su/ )

• SAL- Computer Graphics, Images Signals - Modelers - MSDL
• SAL- Other Scientific Fields - Electrical Related Software - SLS
• A Kernel Model for Precision Timekeeping

... Химического факультета МГУ . Спецкурсы кафедры химической энзимологии . Программа спецкурса . Биоинформатика - предмет и методы исследований, основные приложения. ... Математические основы выравнивания последовательностей символов. ... Поиск гомологичных последовательносткй ДНК/белков в базах данных. ... Современные методы предсказания вторичной и третичной структуры белков на основе первичной структуры. Метод моделирования по гомологиям. ... Стратегия моделирования структуры белков: . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>3372) - chem.msu.ru/ )

• What Defines The Activation Energy of Electron Transfer: Reorganization Energy

Next: Getting started with LanHEP Up: The LanHEP Handbook Previous: The LanHEP Handbook Contents . ... LanHEP makes possible the generation of Feynman rules for propagators and vertices in momentum representation starting from the Lagrangian defined by a user in some simple format very similar to canonical coordinate representation. The user should prepare a text file with description of all Lagrangian terms in the format close to the form used in standard publications. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>1157) - theory.sinp.msu.ru/ )

• Structure of LanHEP input file
• Simplifying the expression for vertices
• Getting started with LanHEP

ОСНОВЫ КОМПЬЮТЕРНОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ ОСАДОЧНЫХ БАССЕЙНОВ. Особенностью осадочного чехла в осадочном бассейне является его слоистое строение. ... Среди задач моделирования осадочного бассейна можно выделить моделирование истории погружения бассейна и моделирование процессов в литосфере, вызывающих это погружение. ... В идеальном случае, восстановленная по геологическим данным история погружения осадочного бассейна должна совпасть с теоретической моделью деформаций литосферы. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>11366) - geo.web.ru/ )

• Dictionary_T
• Dictionary_M
• Атомистическое компьютерное моделирование кристаллической структуры и свойств

grdtrend - Fit and/or remove a polynomial trend in a grd file grdtrend grdfile -N n _ model [ r ] [ -D diff . grd ] [ -T trend . ... grd ] grdtrend reads a 2-D gridded file and fits a low-order polynomial trend to these data by [optionally weighted] least-squares. ... Optionally, append r to the -N option to perform a robust fit. ... N n _ model [ r ] sets the number of model parameters to fit. Append r for robust fit. ... D Write the difference (input data - trend) to the file diff . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>873) - xray.sai.msu.ru/ )

• Galactic Gravitational Wave Background
• Initial parameters of compact stars
• Calculation of Evolutionary Tracks

... The <P> element is used to define a paragraph. ... The ALIGN attribute can be used to explicitly specify the horizontal alignment. ... Note: Do not use empty paragraphs to add white space around headings, lists or other elements. ... By convention, the class names are interpreted hierarchically, with the most general class on the left and the most specific on the right, where classes are separated by a period. ... You can then explicitly specify line breaks in paragraphs using the BR element. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>179) - comet.sai.msu.ru/ )

• Horizontal Tabs
• Banners
• Hypertext Links

... The Millennium that Defined Earth . ... The Earth started as the center of everything , but became a planet placed in the Solar System , which became placed in a Galaxy , which became placed in the Local Group of Galaxies , which became placed in an expanse so vast we call it just the Universe . ... Публикации с ключевыми словами: Earth - Y2K - millennium - структура Вселенной - Система мира Птолемея - Система мира Коперника - геоцентрическая система Мира . ... Земля в сумерках . Восход Земли . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>36562) - www.astronet.ru/ )

• Астронет > The Millennium that Defines Universe
• Астронет > Моделирование Вселенной
• The Millennium that Defined Earth

... Model , Rus. ... Analysis and Math.Modelling , Russian J. Numerical Anal. ... Modelling , Russian Journal Numerical Analysis and Mathematical Modelling . ... Kobelkov G.M. , Zvyagin A.V. в журнале Russian Journal of Numerical Analysis and Mathematical Modelling , издательство V S P (Netherlands) , том 30, ? ... Tretyakova Rufina M. , Andreas Meyerhans, Bocharov Gennady A. в журнале Russian Journal of Numerical Analysis and Mathematical Modelling , издательство V S P (Netherlands) , том 30, ? ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>26029) - istina.msu.ru/ )

• Computational Mathematics and Modeling - журнал | ИСТИНА - Интеллектуальная
• Journal of Chemical Information and Modeling - журнал | ИСТИНА -
• Mathematical modelling of natural phenomena - журнал | ИСТИНА -

Network Working Group X. Liu Internet-Draft Ericsson Intended status: Standards Track I. Bryskin Expires: September 20, 2016 Huawei Technologies V. Beeram Juniper Networks T. Saad Cisco Systems Inc H. Shah Ciena O. Gonzalez de Dios Telefonica March 20, 2016 A YANG Data Model for Configuration Scheduling draft-liu-netmod-yang-schedule-00 Abstract This document describes a data model grouping for configuration scheduling. ... Liu, et al. ... Configuration Scheduling YANG Data Model Overview.. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>17863) - mirror.msu.net/ )

• http://mirror.msu.net/pub/rfc-editor/rfc-ed-all/mibs/private.mibs/twg.txt
• http://mirror.msu.net/pub/rfc-editor/internet-drafts/draft-zheng-intarea-gre-yang-01.txt
• http://mirror.msu.net/pub/rfc-editor/internet-drafts/draft-lear-ietf-netmod-acl-dnsname-00.txt

... Обзор основных понятий графической нотации и семантики языка UML. Unified Modeling Language (UML) - унифицированный язык моделирования. Понятие метамодели системы. ... Диаграммы классов и объектов. ... Семантика языка UML. ... Использование графической нотации языка UML как средства описания метамодели CASE-системы. ... Связь обозначений графической нотации языка UML и представляющих их базовых классов метамодели. ... Средства языка UML для моделирования систем с дискретным числом состояний. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>535) - oit.cmc.msu.ru/ )

• defined
• get_defined_constants
• get_defined_vars