Histone-like proteins from archaea beta-Glucosyltransferase (DNA-modifying) C-terminal domain of RNA polymerase alpha subunit CAP C-terminal domain -like DNA repair glycosylase, 2 C-terminal domains DNA repair protein MutS, domain I DNA-binding protein LAG-1 (CSL) DNA-binding protein LAG-1 (CSL) Endonuclease III Group I mobile intron endonuclease Intein (protein splicing domain ) Intein ... Rel/Dorsal transcription factors, DNA-binding domain . ... 19-191 . ... Protein domain: . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>6276) - monkey.belozersky.msu.ru/ )

• PDB entries containing domains of the family "Bacterial trigger factor protein
• PDB entries containing domains of the family "Elongation factor Tu domain 2"
• PDB entries containing domains of the family "Elongation factor Tu GTP binding

The list of Archaea domains composed the orthologuos groups of the set 2, 3 and 4 Pfam AC Pfam ID Description PF00164 Ribosomal _S12 Ribosomal protein S12 PF00177 Ribosomal _S7 Ribosomal protein S7p/S5e PF00181 Ribosomal _L2 Ribosomal Proteins L2, RNA binding domain PF00189 Ribosomal _S3_C Ribosomal protein S3, C-terminal domain PF00203 Ribosomal _S19 Ribosomal ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>19) - mouse.genebee.msu.ru/ )

• http://mouse.genebee.msu.ru/phylogeny/Domains_set1.doc
• Comparison of protein phylogeny reconstruction methods

... Interaction classes . Families of interaction class . Classes of protein-DNA interaction of SCOP families . ... CAP C-terminal domain-like . SSM . middle . ... high . ... KorB DNA-binding domain-like . ... Restriction endonuclease BglII . ... Middle domain of MutM-like DNA repair proteins . ... DNA-binding N-terminal domain of transcription activators . ... Recombinase DNA-binding domain . ... Viral DNA-binding domain . ... p53 DNA-binding domain-like . ... NPIDB team 2003 - 2016 . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>14) - npidb.belozersky.msu.ru/ )

• NPIDB: Home

Выберите категорию обращения: Общие вопросы Отчеты Рейтинги Диссертационные советы Конкурсы Ввод данных Структура организаций Пользователи Проблемы с регистрацией\входом в систему . ... Войти в систему . ... Ivanova Elena V. , Kolosov Peter M. , Birdsall Berry , Kelly Geoff , Pastore Annalisa , Kisselev Lev L. , Polshakov Vladimir I. в журнале FEBS Journal , издательство Blackwell Publishing Inc. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>1992) - istina.msu.ru/ )

• Kolosov Peter M. - сотрудник | ИСТИНА - Интеллектуальная Система Тематического
• Ivanova Elena V. - сотрудник | ИСТИНА - Интеллектуальная Система Тематического
• Factor M.I. - сотрудник | ИСТИНА - Интеллектуальная Система Тематического

... 1.PROTEIN (TRANSCRIPTION FACTOR E2F-4), DNA-BINDING DOMAIN (ДНК-связывающий домен белка . фактор транскрипции E2F-4).Одна цепь - A. 2.PROTEIN (TRANSCRIPTION FACTOR DP-2), DNA-BINDING DOMAIN (ДНК-связывающий домен белка . ... Цепь А белка(фактор транскрипции E2F-4), . Цепь B белка(фактор транскрипции DP-2) и цепи С и D, представляющие ДНК со следующей последовательностью: . ... Белок (фактор транскрипции E2F-4) . ... Описать ДНК-белковые контакты в заданной структуре. ... Первый контакт . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>3338) - kodomo.cmm.msu.ru/ )

• Report1/Term5/2008 SCOP и CATH
• Student's numbers
• SCOP и CATH

Электронная библиотека Попечительского совета . ... Anderson Daniel - Factorization in integral domains . ... Название: Factorization in integral domains . Автор: Anderson Daniel . ... Domain, bounded factorization 4 173 . ... Domain, finite factorization (FFD) 36 173 235 . ... Domain, integrally closed 297 . ... Domain, rationally bounded factorization 4 . Domain, strong finite factorization 36 235 . ... Электронная библиотека попечительского совета мехмата МГУ , 2004-2016 . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>5643) - lib.mexmat.ru/ )

. Название публикации . NMR solution structure and function of the C-terminal domain of eukaryotic class 1 polypeptide chain release factor . Авторы . A.B. Mantsyzov, E.V. Ivanova, B. Birdsall, E.Z. Alkalaeva, P.N. Kryuchkova, G. Kelly, L.Y. Frolova, V.I. Polshakov . Дата . 31.12.2009 23:00:00 . Название журнала . FEBS Journal. Том . V.277. первая страница . 2611 . последняя страница . 27. Купить нет на складе . 2009 ФФМ МГУ, 2009

Еще в разделе: (Показать все результаты (>10) - fbm.msu.ru/ )

GntR family of bacterial transcription factors and their binding motifs: structure and co-evolution I.A. Suvorova Institute for Information Transmission Problems RAS (the Kharkevich Institute), Bolshoi Karetny per. ... We have shown that for FadR, HutC, and YtrA subfamilies nucleotide and amino acid positions that likely determine binding specificity correspond well to those identified for the protein-DNA structure of FadR (E.coli) [1]. ... 2001) The FadR-DNA Complex. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>256) - mccmb.belozersky.msu.ru/ )

• http://mccmb.belozersky.msu.ru/2013/abstracts/abstracts/204.pdf
• http://mccmb.belozersky.msu.ru/2015/proceedings/abstracts/121.pdf
• http://mccmb.belozersky.msu.ru/2015/proceedings/abstracts/126.pdf

. The work is supported by the Russian Foundation for Basic Research, grant 10-07-00685-a . PDB . Classification . Domain instances . Bonded with NA . 1B01 . GENE REGULATION/DNA . 2 . 2 . 1EA4 . GENE REGULATION/DNA . 10 . 10 . 2HZV . METAL BINDING PROTEIN/DNA . 8 . 8 . total (3 entries) . 20 . 20 . No comments on this family . Send your questions and comments to sas@belozersky.msu.ru .

Еще в разделе: (Показать все результаты (>10369) - mouse.belozersky.msu.ru/ )

• PDB entries containing domains of the family "RNA dependent RNA polymerase"
• MTPro
• Cluster 3

filter1d - Time domain filtering of 1-D time series filter1d [ infile ] -F < type >< width > [ -D increment ] [ -E ] [ -H [ nrec ] ] [ -I ignore _ val ] [ -L lack _ width ] [ -N n _ cols / t _ col ] [ -Q q _ factor ] [ -S symmetry _ factor ] [ -T start / stop / int ] [ -V ] [ -bi [ s ][ n ] ] [ -bo [ s ] ] filter1d is a general time domain filter for multiple column time series data. The user specifies the number of columns of input and which column is the time. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>133) - xray.sai.msu.ru/ )

... Three-dimensional structure of alpha-crystallin domain dimers of human small heat shock proteins HSPB1 and HSPB6. ... Small heat shock proteins (sHSPs) are a family of evolutionary conserved ATP-independent chaperones. ... To further analyze the structure of ACD dimers, we have employed a combination of X-ray crystallography and solution small-angle X-ray scattering (SAXS) to study the ACD-containing fragments of human HSPB1 (HSP27) and HSPB6 (HSP20). ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>121) - biochem.bio.msu.ru/ )

• The role of intrinsically disordered regions in the structure and functioning
• The taming of small heat-shock proteins: crystallization of the
• Structure, properties, and functions of the human small heat-shock protein

... refactoring of pdb-related code * remove (transiently) secstr from pdb.py * refactoring of pdb loading * create module protein_pdb with 4 classes with both properties * make geometrical-core work (with errors and without saving to fasta) . ... 1 import base . ... 4 import protein . ... 6 class Monomer ( base . ... 16 """User defined protein; list of protein_sequences.""" . ... 22 class Alignment ( base . ... 25 def muscle_align ( self ): . ... 30 tmp_file = NamedTemporaryFile ( delete = False ) . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>15516) - kodomo.fbb.msu.ru/ )

• allpy: 670ae384aa37 allpy/protein.py
• allpy: 3ce9ab9a5d29 allpy/protein.py
• allpy: allpy/protein.py diff

... Terenin IM, Dmitriev SE, Andreev DE, Shatsky IN. 2008) Eukaryotic translation initiation machinery can operate in a bacterial-like mode without eIF2. Nat Struct Mol Biol . ... PubMed ][ PDF ] . ... 2007) Efficient translation initiation directed by the 900-nucleotide-long and GC-rich 5' untranslated region of the human retrotransposon LINE-1 mRNA is strictly cap dependent rather than internal ribosome entry site mediated. ... 2001) Molecular mechanisms of translation initiation in eukaryotes. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>235) - www.genebee.msu.ru/ )

• Impact Factors of Scientific Journals in 1999

Heavy-ion collisions in modified AdS spaces Pozdeeva E.O based on work I.Ya. ... Gubser, Klebanov, Polyakov, 9802109 Witten, 9802150 The gravitational shock wave in AdS 5 space is dual to ultrarelativistic heavy-ion in 4D space-time. ... DISCREPANCY The simple holographic model gives dN c h / d s 2/ 3 The mininal black hole entropy can be estimated by trapped surface area S S trapped =A trapped / 4G N The trapped surface is surface whose null normals all propagate inward. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>128) - qfthep.sinp.msu.ru/ )

• http://qfthep.sinp.msu.ru/talks/pr_Gamzova.pdf
• http://qfthep.sinp.msu.ru/talks2011/Kanshin_qfthep.pdf

... 101 (FDH_PSESR, P33160) (PF00389; 2-Hacid_dh) (PF02826; 2-Hacid_dh_C): 2-Hacid_dh 47-144; 2-Hacid_dh_C 150-332 Lineage: Root: scop Class: Alpha and beta proteins (a/b) Mainly parallel beta sheets ( beta - alpha - beta units) Fold: NAD(P)-binding Rossmann-fold domains core: 3 layers, a/b/a; parallel beta -sheet of 6 strands, order 321456 The nucleotide-binding modes of this and the next two folds/superfamilies are similar Superfamily ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>18411) - dualopt1.cmm.msu.ru/ )

• %TOPICTITLE% (8 vs. 9) - TWiki
• %TOPICTITLE% (2 vs. 3) - TWiki

Roman Sutormin rsutormin@gmail.com Professional experience 05/2013 ­ present: Lawrence Berkeley National Laboratory (Berkeley, CA, USA) Software developer Development of JSON based storage system used for keeping biological data involved in public KBase services. ... 10/2009 ­ 08/2011: Mail.Ru Group (Moscow, Russia), Software developer Support and development of data warehouse (PostgreSQL) and administration web tool (JBoss + GWT) on serverside of MMO game "Allods Online". ... 2013 Jul 1514(1):476. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>12) - storage.bioinf.fbb.msu.ru/ )

• http://storage.bioinf.fbb.msu.ru/~roman/Sutormin_CV_aug2013.pdf

. Портал | Содержание | О нас | Авторам | Новости | Первая десятка | Дискуссионный клуб | Научный форум | Отправить открытку . Первая десятка "Русского переплета" Темы дня: . | Обращение к Дмитрию Олеговичу Рогозину по теме "космические угрозы": как сделать систему предупреждения? . Дизайн Русский переплет .

Еще в разделе: (Показать все результаты (>158) - www.pereplet.ru/ )

COMPARATIVE ANALYSIS OF THE STRUCTURE OF THE CHANNEL DOMAIN OF PENTAMERIC LIGAND-GATED ION CHANNELS Popinako A.V., Shaytan K.V. Lomonosov Moscow State University, Dept. of Bioengineering, Russia, 119992, Moscow, Leninskie gori 1/73, tel. ... Molecular modeling remains the only approach for studying of the 5-HT3 receptor structure, which is needed for understanding of its role in neurophysiological processes and predicting specific ligands that may serve as drugs during different neurological diseases. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>89) - www.mce.biophys.msu.ru/ )

• http://www.mce.biophys.msu.ru/archive/doc151941/eng.pdf
• http://www.mce.biophys.msu.ru/archive/doc150984/eng.pdf
• http://www.mce.biophys.msu.ru/archive/doc31419/doc.pdf

... Adam, S.A. , Sterne Marr, R. and Gerace, L. (1990) Nuclear protein import in permeabilized mammalian cells requires soluble cytoplasmic factors. J. Cell Biol., ... 1999. ... Hu, W., and Jans, D. A. (1999) Efficiency of Importin a/b-Mediated Nuclear Localization Sequence Recognition and Nuclear Import J. Biol. ... Kehlenbach R. H. and L. Gerace (2000) Phosphorylation of the Nuclear Transport Machinery Down-regulates Nuclear Protein Import in Vitro , J. Biol. ... Kap104p-mediated Nuclear Import. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>446) - www.nature.web.ru/ )

• Шапероны и прионы: регуляция конформационный состояний прионного белка дрожжей
• Молекулярно-биологические аспекты имплантации у человека и животных
• Изучение белок-белковых взаимодействий. Метод двойного гибрида

FuzzyCLIPS . FuzzyCLIPS is an enhanced version of CLIPS to allow the implementation of fuzzy expert systems. The modifications made to CLIPS contain the capability of handling fuzzy concepts and reasoning. ... License Type: Free for Educational and Research Purposes (commercial licence available) . ... http://ai.iit.nrc.ca/IR_public/fuzzy/fuzzyClips/fuzzyCLIPSIndex.html . ... Available Binary Packages: . ... None . ... SAL Home | Other Scientific Fields | Artificial Intelligence . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>452) - www.sai.msu.su/ )

• SAL- Other Scientific Fields - Electrical Related Software - ViPEC
• SAL- Other Scientific Fields - Chemistry, Biology Related - DomainFinder
• Sternberg Astronomical Institute