Scoring Matrices . Matrix Sequences Sequence Consisting of the first four Amino Acids in the Protein GYRB_ECOL: . ... Sequence Achieved by Substitution of the 2nd and 4th Amino Acid and Insertion between the 3d and 4th Amino Acid, in the Protein GYRB_ECOLI, to randomly chosen new amino acids: . ... Matrix Sequences Sequence Consisting of the First Nine Amino Acids of the Protein GYRB_ECOLI: . ... Sequence Consisting of 2nd, 3d, 7th, 8th and 9th Amino Acid Residues of the Protein GYRB_ECOLI: . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>5156) - kodomo.cmm.msu.ru/ )

• Множественное выравнивание.

Anchoring patterns and point mutations in pairwise alignments using AlignMe X-ray crystal structures have revealed that numerous membrane proteins, such as GPCRs or some secondary transporters, despite the lack of any detectable sequence similarity between them, still share very similar 3D structures. ... The novel feature allows the user to define any number of anchors with varying strength for improving the quality of pairwise alignments in challenging cases lacking notable sequence similarity. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>319) - mccmb.belozersky.msu.ru/ )

• http://mccmb.belozersky.msu.ru/2013/abstracts/abstracts/237.pdf
• http://mccmb.belozersky.msu.ru/2015/proceedings/abstracts/161.pdf
• http://mccmb.belozersky.msu.ru/2015/proceedings/abstracts/163.pdf

SVETKA, a program for Analysis of Multiple Sequence Alignments . ... T his is a database of some analysed "model" alignments. These sets of amino acid sequences were taken from COGs database . ... Results of the analysis of "model" alignments are acceptable from the table below. Every alignment is called VAL xxxx , where xxxx is the number of the original COG (e.g. VAL1188 is obtained from COG1188 ). Alignment name . ... of sequences . Alignment length . Alignment quality . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>6945) - monkey.belozersky.msu.ru/ )

• About this project
• SDP home page
• ETS_all_contacts alignment

... Changed the way related types are stored for Alignment, Block, Sequence, Monomer Now each of them has attribute 'type', which is an object with four attributes: - Alignment - Block - Sequence - Monomer . ... allpy/base.py allpy/dna.py allpy/protein.py allpy/rna.py . ... allpy/base.py . ... allpy/dna.py . ... allpy/protein.py . ... allpy/rna.py . ... 1.59 - # Actually given value at EOF, since name Block is not yet defined 1.60 - 1.61 - sequence_type = Sequence 1.62 - """Type of sequences in...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>39853) - kodomo.fbb.msu.ru/ )

• allpy: 4f3d6b0af90b allpy/block.py
• allpy: df571a5233fb allpy/protein.py
• allpy: 12b97ab5cdc7 allpy/block.py

... Minimal size of Clud clusters (residues) . ... An alignment of a set of structures is a set of positions , to each position some atoms from different structures correspond. ... Hydrophobic cluster of a single protein structure is a separated pool of nonpolar atoms. Usually there is the biggest cluster in the protein called hydrophobic core. ... ConClus program is able to detect of conservative hydrophobic clusters for a family of related protein domains or just for a set of aligned proteins. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>35) - mouse.genebee.msu.ru/ )

• Nhunt: program for nucleic acid sequence similarity search
• Nhunt
• Align tool for DNA-protein complexes

SVETKA, a program for Analysis of Multiple Sequence Alignments . ... Analyse your alignment . ... Alignment . Nota Bene! .aln or .fasta format required!! Look here for comments . ... Nota Bene! Special scheme format required! ... Development of the program is supported by Ministry of Education and Science of the Russian Federation (State Contract No. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>11990) - mouse.belozersky.msu.ru/ )

• S : rm_systems
• Geometrical core
• Example of alignment

... Lathrop R.H., Rogers Jr R.G., Smith T.F. - A Bayes-optimal sequence-structure theory that unifies protein sequence-structure recognition and alignment . ... Название: A Bayes-optimal sequence-structure theory that unifies protein sequence-structure recognition and alignment . Авторы: Lathrop R.H., Rogers Jr R.G., Smith T.F. Аннотация: . A rigorous Bayesian analysis is presented that unifies protein sequence-structure alignment and recognition. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>5107) - lib.mexmat.ru/ )

• Althaus E. - A branch-and-cut algorithm for multiple sequence alignment ::
• Brown S.M. - Bioinformatics: A Biologist's Guide to Biocomputing and the
• Korf I., Yandell M., Bedell J. - Blast (Basic Local Alignment Search Tool) ::

... Algorithm & . Format requirements . ... SDPsite is a tool for identification of protein active and other functional sites, based on spatial clustering of SDPs (specificity-determining positions, described here ) with CPs (conserved positions). ... Mapping predictied positions onto structure and construction of the best cluster . ... The input data of the algorithm are a multiple protein alignment divided into specificity groups . ... is called statistical significance of the set of k* positions . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>144) - bioinf.fbb.msu.ru/ )

• SDPlight
• RNA Alignment
• SDPpred

Выберите категорию обращения: Общие вопросы Отчеты Рейтинги Диссертационные советы Конкурсы Ввод данных Структура организаций Пользователи Проблемы с регистрацией\входом в систему . ... Войти в систему . ... Koonin E.V. , Gorbalenya A.E. в журнале Protein sequences & data analysis , издательство Springer International (Berlin, Germany) , том 5, ? ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>2894) - istina.msu.ru/ )

• DNA sequence : the journal of DNA sequencing and mapping - журнал | ИСТИНА -
• Journal of Integer Sequences - журнал | ИСТИНА - Интеллектуальная Система
• METHOD FOR SIMULTANEOUSLY DETECTING A PLURALITY OF RNA SEQUENCES IN A

Изучение статистики наиболее длинной общей подпослеовательности двух случайных подпоследовательностей является одной из самых интересных и трудных задач вычислительной математической биологии. В докладе будут представлены результаты, касающиеся статистического распределения общих подпоследовательностей в упрощенном (некоррелированном) варианте модели, т.наз. модели Бернулли . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>161) - polly.phys.msu.ru/ )

• Selected publications of Chertovich, Alexander Viktorovich
• Selected publications of Lazutin, Alexei Alexandrovich
• Sequence Design of Copolymers with Special Functional Properties - Chair of

... Another way to fend off and detect impostors is to use call sequence checks. Call sequence checks help you protect against intruders that somehow managed to find out the password you log into your UUCP system with. ... When the attacker call your UUCP feed and steals your mail, this will increase the feeds call sequence number by one. ... If you have enabled call sequence checks, you should check your log files regularly for error messages that hint at possible attacks. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>141) - itpm.msu.su/ )

• UUCP-based Transports

under the terms of the GNU General Public License v2 # $Id$ EAPI=5 inherit eutils flag-o-matic toolchain-funcs DESCRIPTION= FASTA is a DNA and Protein sequence alignment software package HOMEPAGE= http:// fasta .bioch.virginia.edu/ fasta _www2/ fasta _down.shtml SRC_URI= http://faculty.virginia.edu/wrpearson/${PN}/${PN}36/${P}.tar.gz LICENSE= ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>12861) - mirror.msu.net/ )

• http://mirror.msu.net/pub/gentoo-portage/sci-biology/fasta/fasta-35.4.10.ebuild
• http://mirror.msu.net/pub/gentoo-portage/sci-biology/embassy-clustalomega/embassy-clustalomega-1.1.0.ebuild
• http://mirror.msu.net/pub/gentoo-portage/sci-biology/clustal-omega/clustal-omega-1.2.1.ebuild

... Химического факультета МГУ . Спецкурсы кафедры химической энзимологии . Программа спецкурса . Биоинформатика - предмет и методы исследований, основные приложения. ... Математические основы выравнивания последовательностей символов. ... Поиск гомологичных последовательносткй ДНК/белков в базах данных. ... Современные методы предсказания вторичной и третичной структуры белков на основе первичной структуры. Метод моделирования по гомологиям. ... Стратегия моделирования структуры белков: . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>447) - chem.msu.ru/ )

• Moscow University Chemistry Bulletin Vol. 55, No. 2, P. 79 (2014)
• Entrance Examinations - Preliminary Round
• Moscow University Chemistry Bulletin Vol. 52, No. 3, P. 175 (2011)

. [ Войти ] . Главная -> Фильмы -> The Lost Spider Pit Sequence . Пользователи . Демо . Деньги . Фильмы . Форум . The Lost Spider Pit Sequence . Новая Зеландия 2005 . отметить . Фантастика . Ужасы . Триллер .

Еще в разделе: (Показать все результаты (>45) - kinfo.ru/ )

• The Transporter 2 - Фильмы - Kinfo.ru
• Transporter 3 - Фильмы - Kinfo.ru

... A protein whose binding to Na,K-ATPase is regulated by ouabain. ... Immunoprecipitation of Na,K-ATPase from kidney homogenate by antibodies against alpha1-subunit results in the precipitation of several proteins together with the Na,K-ATPase. A protein with molecular mass of about 67 kD interacting with antibodies against melittin (melittin-like protein, MLP) was found in the precipitate when immunoprecipitation was done in the presence of ouabain. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>124) - biochem.bio.msu.ru/ )

• Phosphorylation by cyclic AMP-dependent protein kinase inhibits chaperone-like

... Главная последовательность (ГП) - наиболее населенная область на диаграмме Гецшпрунга - Рессела (ГР). ... Основное время жизни звезда проводит на главной последовательности и поэтому главная последовательность - наиболее населенная группа на диаграмме ГР (до 90% всех звезд лежат на ней). ... Для звезд главной последовательности существует апроксимационное соотношение, известное как зависимость масса-светимость. ... Звезды проводят большую часть своей жизни на главной последовательности. ... 33,000 ....

Еще в разделе: (Показать все результаты (>815) - crydee.sai.msu.ru/ )

• Standard Schoolhouse Rock Introduction Sequence
• Image: Bicycle is the most popular transport in Amsterdam

Home . Database of structures of nucleic acid - protein complexes . ... List of complexes . Pfam families . SCOP families . Interaction classes . ... NPIDB . ... Information on SCOP and Pfam domains detected in protein chains is presented. ... Each family has its own web page with the list of entries that include domains of the family. ... List of SCOP domains occurred in DNA-protein and RNA-protein complexes is organized in tree-like form, according to the SCOP classification. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>16) - npidb.belozersky.msu.ru/ )

... x264 is an open source codec of standard MPEG4 AVC/H.264, developed by programmers from all over the world. ... Accumulated during previous frames' compressions statistic is actively used by codec to improve effectiveness of adaptive models. ... These parameters are used only before encoding start, so, our improvements are more significant for short sequences. ... 3 Results of codec x264 modification on "flower" sequence . ... 5 Results of codec x264 modification on "flower" sequence, low bitrates ....

Еще в разделе: (Показать все результаты (>137) - graphics.cs.msu.ru/ )

• Novel Approach for Video Codecs Scoring using Specially Prepared Video
• Video Matting Benchmark | Graphics and Media Lab Equation Equation Equation
• x264 codec improvement | Лаборатория компьютерной графики и мультимедиа

... TWikiMetaData . ... Meta Data Syntax . ... META:FORM . ... Additional topic data, program-generated or from TWikiForms , is stored in META variable name/value pairs . TWikiMetaData uses META variables to store topic data that's separate from the main free-form content. ... Use META variables to format and display Meta Data. Format is the same as in TWikiVariables , except all fields have a key. ... Note: Please contribute updates to this topic on TWiki.org at TWiki:TWiki.TWikiMetaData . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>28600) - dualopt1.cmm.msu.ru/ )

• TWikiMetaData - TWiki - TWiki - (printable)

Используя базовые типы и применяя небольшой набор способов построения, можно получать сложные типы. ... Получаемые в результате типы называют структурированными. В ASN.1 определяется шесть способов структурирования: "последовательность" (SEQUENCE), "последовательность из" (SEQUENCE OF), "множество" (SET), "множество из" (SET OF), выборочный тип (CHOICE), селективный тип. ... Селективный тип - это структурированный тип, определяемый указанием одного из типов-компонентов выборочного типа. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>106) - oit.cmc.msu.ru/ )

• array_slice
• imap_clearflag_full
• imap_setflag_full