Поиск по:kodomo.cmm.msu.su -
Поискать по всем серверам
На этой странице приведены все страницы сервера kodomo.cmm.msu.su ,которые мы индексируем. Показаны документы 8041 - 8060 из 8225.
Упорядочить по:
URL
|
дате изменения
8041. http://kodomo.cmm.msu.su/FBB/year_03/doc/term3/task2.doc
... 2) С помощью программы fiber пакета 3DNA постройте A- и B-форму дуплекса ДНК, последовательность одной из нитей которого - 4 раза повторенная последовательность "gatc". Структуру дуплекса в А-форме сохраните в файле gatc-a.pdb, а структуру дуплекса в В-форме сохраните в файле gatc- b.pdb. ... Результаты Ваших наблюдений занесите в таблицу документа Word, сохраните документ в файле c названием analysis.doc. ... 4) Проведите анализ Ваших структур, используя средства пакета 3DNA (find_pair, analyze). ...
[
Текст
]
Ссылки http://kodomo.cmm.msu.su/FBB/year_03/doc/term3/task2.doc -- 29.0 Кб -- 14.09.2004
Похожие документы
Похожие документы
8042. WARNING
. ПРЕДУПРЕЖДЕНИЕ!!! . Содержание этой страницы не касается наших занятий по биоинформатике. Если вам еще нет шестнадцати, или вы ABR, просьба вернитесь на предыдущую страницу .
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.cmm.msu.su/~siniy/megachel.htm -- 1.8 Кб -- 09.09.2004
Похожие документы
Похожие документы
8043. http://kodomo.cmm.msu.su/FBB/year_03/doc/task_1.doc
... Включите компьютер (см. подсказку). ... Пошлите письмо преподавателям (см. подсказку). ... Пошлите второе письмо преподавателям с результатами упражнений 3.1-3.3. ОС Windows позволяет одновременную работу в нескольких окнах. ... Откройте окно для письма «New Message» (см. подсказку), растяните его на нижнюю половину экрана. ... Не закрывая окна с письмом, откройте окно поиска файлов (см. подсказку) и калькулятор. ... Не закрывая окна с письмом, откройте новый документ в редакторе Word. ...
[
Текст
]
Ссылки http://kodomo.cmm.msu.su/FBB/year_03/doc/task_1.doc -- 34.0 Кб -- 07.09.2004
[ Текст ] Ссылки http://kodomo.cmm.msu.su/FBB/year_04/doc/task_1.doc -- 34.0 Кб -- 14.10.2004
Похожие документы
[ Текст ] Ссылки http://kodomo.cmm.msu.su/FBB/year_04/doc/task_1.doc -- 34.0 Кб -- 14.10.2004
Похожие документы
8044. http://kodomo.cmm.msu.su/FBB/year_03/doc/term3/help1.doc
... Рекомендуемый порядок действий: (1) Используя Template => Template Window => DNA/RNA kit нарисуйте дезоксирибозу и пронумеруйте (кнопка # в режиме Structure) атомы углерода . ... 4) Вставьте 4е основания, надпишите их (режим Draw, 3я кнопка снизу в левом меню-столбце) и выделите цветом азот, соединяемый с C1 атомом остова. 5) Соедините основания с остовом и надпишите 5' и 3' концы. ... Рекомендуемый порядок действий. 1) Скопируйте из Template пару оснований на страницу. ...
[
Текст
]
Ссылки http://kodomo.cmm.msu.su/FBB/year_03/doc/term3/help1.doc -- 32.0 Кб -- 07.09.2004
Похожие документы
Похожие документы
8045. http://kodomo.cmm.msu.su/FBB/year_03/doc/term3/task1.doc
Задание: 1) Зайдите в свою домашнюю директорию и создайте директорию Term3 и в ней создайте поддиректорию Practice1. ... 2) В программе Chemsketch создайте файл nucl и, используя набор заготовок, постройте цепь ДНК, состоящую из 4 нуклеотидов T,C,A,G. Перенумеруйте азоты дезоксирибозы. ... Выделите сиреневым азоты оснований, связанные с остовом. ... Водородные связи нарисуйте пунктиром. ... Одна пара оснований - один лист. ... Отметьте те пары, которые, по Вашему мнению, являются каноническими. ...
[
Текст
]
Ссылки http://kodomo.cmm.msu.su/FBB/year_03/doc/term3/task1.doc -- 22.0 Кб -- 07.09.2004
Похожие документы
Похожие документы
8046. Биоинформатика 2003: Семестр2
Биоинформатика . ... Студенты . Преподаватели . ... Студенты знакомятся с базами данных - Swiss-Prot, TrEMBL, UniProt, а также делают первую попытку что-нибудь в них найти. [задания] [ключевые слова] [материалы] [презентация] . ... Искусство поиска или SRS (ПСН) . Преподаватели рассказывают о том, как правильно построить запрос в системе SRS, студенты учатся работать с логическими операциями и создают первую пробную выборку а.к. последовательностей. [задания] [ключевые слова] [презентация] . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.cmm.msu.su/FBB/year_03/sem2.htm -- 14.6 Кб -- 16.06.2004
Похожие документы
Похожие документы
8047. http://kodomo.cmm.msu.su/FBB/year_03/doc/task27.doc
... Филогенетическое дерево (phylogenetic tree). ... Алгоритмы, основанные на матрицах попарных эволюционных расстояний. ... Матрицу наивных попарных эволюционных расстояний сохраните в виде текстового файла my_prot.dist следующего формата: 2. ... В отчете укажите полные названия алгоритмов, для каждого приведите правильную скобочную структуру дерева (см. файлы outtree.* ... На основе Вашей матрицы попарных расстояний постройте «вручную» дерево по алгоритму UPGMA (по образцу в презентации). ...
[
Текст
]
Ссылки http://kodomo.cmm.msu.su/FBB/year_03/doc/task27.doc -- 141.0 Кб -- 16.06.2004
Похожие документы
Похожие документы
8048. Описание свойств LpxA E.coli в производных базах данных
Описание свойств LpxA E.coli в производных базах данных . ... Базы данных Prosite, Pfam и Interpro - базы, содержащие в себе информацию об известных доменах, мотивах и других известных функционально важных участках белков. Базы данных построены на разных принципах и служат различным целям. В основе Prosite лежат паттерны, фиксирующие мотивы функциональных сайтов белков. ... Interpro - интегрированная база данных, объединяющая разного рода информацию из различных баз данных. ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.cmm.msu.su/~siniy/term2/domens.html -- 3.6 Кб -- 31.05.2004
Похожие документы
Похожие документы
8049. Результаты изучения записи IPR001451 в интегрированной базе данных InterPro
Результаты изучения записи IPR001451 в интегрированной базе данных InterPro . ... Запись IPR001451 называется Hexapep_transferaze . Тип записи: повтор . Трансферазный гексапептидный повтор черезвычайно часто встречается встречается во всех таксонах кроме вирусов. ... Эта запись относится ("метит") к 1196 белку. Создание этой записи основано на существовании следующих подписей (signature): . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.cmm.msu.su/~siniy/term2/interpro.html -- 3.8 Кб -- 31.05.2004
Похожие документы
Похожие документы
8050. The matrix has us
Выравнавание белковых последовательностей и создание матрицы аминокислотных замен . Работа с программами FAR maneger, Excel, GeneDoc . 1) Создание выравниваний В чисто педагогических целях наши преподаватели предложили нам создать в ручную выравнивания предложенных аминокислотных последовательностей. ... Далее производился подсчет весового коэффициента выравнивания. Указательным пальцем правой руки были подсчитаны совпадающие аминокислотные остатки и гепы. ... Создание матриц . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.cmm.msu.su/~siniy/page_12.htm -- 3.7 Кб -- 31.05.2004
Похожие документы
Похожие документы
8051. Страничка про то че мы творили во втором семестре
Второй семестр . ... Пакет программ EMBOSS (кривые юниксовые проги для разнообразных выравниваний): needle (программа попарного глобального выравнивания), water (программа попарного локального выравнивания), matcher (программа попарного локального выравнивания), emma (программа множественного выравнивания), . Второй семестр еще только начался, а нас уже с головой окунули в целый таз новой,интересной и увлекательной работы. ... Алгоритмы попарного выравнивания . ... Деревья . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.cmm.msu.su/~siniy/term2.htm -- 4.0 Кб -- 31.05.2004
Похожие документы
Похожие документы
8052. http://kodomo.cmm.msu.su/~siniy/trees.doc
... Acc \ Acc |P10440 |Q8Z9A2 |Q87ME9 |Q8YHG8 |Q8YSL4 | ... Матрица эволюционных расстояний cc \ Acc |P10440 |Q8Z9A2 |Q87ME9 |Q8YHG8 |Q8YSL4 | ... 50.4 |45.4 |X |77.5 | ... Эволюция согласно дереву NJ Согласно полученному дереву, от некоего общего предка произошли три белка Q8YHG8, Q8YSL4 и общий предок Q87ME9, Q8Z9A2 и P10440. ... Эволюция согласно дереву UPGMA Согласно этому дереву, от общего ствола ведущего к P10440 последовательно ответвились Q8YSL4, Q8YHG8, Q87ME9 и последним Q8Z9A2 . ...
[
Текст
]
Ссылки http://kodomo.cmm.msu.su/~siniy/trees.doc -- 650.5 Кб -- 31.05.2004
Похожие документы
Похожие документы
8053. Поиск мотивов в последовательности RL25_ECOLI с помощью средств PROSITE
Поиск мотивов в последовательности LpxA E.coli с помощью средств PROSITE . ... В базе данных PROSITE собрана коллекция сайтов, мотивов и доменов. ... С помощью программы ScanProsite (Scan a protein for PROSITE matches) было найдено 7 известных типов мотивов, представленных в белке LpxA 17-ю участками. ... отмечены часто встречающиеся в белках мотивы, . ... Выбранный паттерн: [LIV]-[GAED]-x(2)-[STAV]-x-[LIV]-x(3)-[LIVAC]-x-[LIV]-[GAED]-x(2)- [STAVR]-x-[LIV]-[GAED]-x(2)-[STAV]-x-[LIV]-x(3)-[LIV]. ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.cmm.msu.su/~siniy/term2/prosite.html -- 4.1 Кб -- 29.05.2004
Похожие документы
Похожие документы
8054. Доменная структура белка LpxA E.coli
Доменная структура белка LpxA E.coli . ... База данных PFAM включает 7426 записей с краткой характеристикой разных семейств белковых доменов, включая их множественные выравнивания. ... Согласно базе данных PFAM, в белке LpxA cуществует 7 коротких структурно слабовыраженных доменов и еще структурно выраженный участок из 4-х альфа-спиралей, описанный в Pfam-B, видимо этот участок не смотря на свою структурную обособленность не является достоверным доменом. ... Краткое описание доменов . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.cmm.msu.su/~siniy/term2/pfam.html -- 4.2 Кб -- 29.05.2004
Похожие документы
Похожие документы
8055. Глобальное и локальное выравнивание аминокислотных последовательностей
Глобальное и локальное выравнивание аминокислотных последовательностей . ... вес совпадения = 2 . ... Последовательности, для которых строились локальные выравнивания-LpxA_Ecoli : . ... 10 LpxA_E AFVHPTAIVEE ::::::::::: seq3 AFVHPTAIVEE 10 . ... Номер выравнивания . ... seq3 1 AFVHPTAIVEE 11 LpxA_Ecoli 246 VKAFTDFFARSTRGLIR 262 ||||||||| seq3 12 VKAFTDFFA 20 . ... seq3 1 AFVHPTAIVEE---V--KA----F--------------------- 15 LpxA_Ecoli 51 NGHTKIGRDNEIYQFASIGEVNQDLKYAGEPTRVEIGDRNRIRESVTIHR 100 | ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.cmm.msu.su/~siniy/term2/alignment.html -- 12.7 Кб -- 29.05.2004
Похожие документы
Похожие документы
8056. http://kodomo.cmm.msu.su/FBB/year_03/doc/zachet2c.doc
Типы задач Всего есть 10 типов задач, каждый тип реализован в нескольких вариантах Задача 4а Белок из ... и его ближайший гомолог из .. относятся к одному семейству, содержат один функциональный домен и, возможно, являются ортологами. ... Задача 4б У человека есть белок - .. По последовательности этого белка и его наилучших гомологов из ..... был создан простой паттерн длиной 22 позиции, хорошо распознающий данные белки. Мотив, опознаваемый паттерном, раскрашен на выравнивании. ... Задача ? ...
[
Текст
]
Ссылки http://kodomo.cmm.msu.su/FBB/year_03/doc/zachet2c.doc -- 28.0 Кб -- 25.05.2004
Похожие документы
Похожие документы
8057. Контакты
. Контакты . Работа с RasMol . Исследованы контакты между альфа спиралями в альфаспиральном домене белка, а также немногочисленные контакты этого домены с бетта доменом. Таблица контактов. Похоже что ile212 ile115 phe207 val197 leu202 взаимосвязаны гидрофобнами взаимодействиями . Изображение домена. Ленты-осевой скелет, боковые радикалы изображены в виде сфер на палочках, аминокислоты обозначены. На главную
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.cmm.msu.su/~siniy/page_10.htm -- 2.1 Кб -- 24.05.2004
Похожие документы
Похожие документы
8058. http://kodomo.cmm.msu.su/FBB/year_03/doc/zachet2d.doc
... Умения работать с некоторыми базами данных.. ... Выбирать разделители при вводе, разделять текст на столбцы. ... Построение графика или диаграммы . ... Выбирать базу данных для поиска. ... Вести поиск документа по а) ключевым словам; б) по идентификаторам; в) по аминокислотной последовательности. Просматривать доменную структуру белков, сохранять ее изображение. ... define Умение работать с выражениями для выделения множества атомов, т.е выделять множество атомов по любому сочетанию из: . ...
[
Текст
]
Ссылки http://kodomo.cmm.msu.su/FBB/year_03/doc/zachet2d.doc -- 47.5 Кб -- 21.05.2004
Похожие документы
Похожие документы
8059. http://kodomo.cmm.msu.su/FBB/year_03/doc/zachet2a.doc
... Максимальный балл -10. ... Задание: а) привести все остальные названия (одно-, трехбуквенное, полное русское и английское), (1б) б) нарисовать графическую формулу (2б), в) нарисовать L- и D-изомеры (2б), г) на качественном уровне описать свойства. бокового радикала, следующие из нарисованной графической формулы: размеры, наличие разветвленного углеводородного остова, гидрофобность , полярность, наличие ароматического ядра или заряженных групп (5б). ...
[
Текст
]
Ссылки http://kodomo.cmm.msu.su/FBB/year_03/doc/zachet2a.doc -- 33.5 Кб -- 21.05.2004
Похожие документы
Похожие документы
8060. http://kodomo.cmm.msu.su/FBB/year_03/doc/zachet2b.doc
... Рекомендуем: А.В.Финкельштейн «Физика белка», лекция 1 http://bmbiris.bmb.uga.edu/wampler/tutorial/prot1.html а также дополнительно: http://www.expasy.org/swissmod/course/text/chapter1.htm http://falcon.sbuniv.edu/~ggray.wh.bol/CHE3364/b1c2out.html 2. ... Рекомендуем: http://bmbiris.bmb.uga.edu/wampler/tutorial/prot2.html а также дополнительно: http://www.expasy.org/swissmod/course/text/chapter1.htm 3. ... Рекомендуем: см. презентацию к занятию ? ... Глобальное выравнивание. ... Рекомендуем: 1) см. ...
[
Текст
]
Ссылки http://kodomo.cmm.msu.su/FBB/year_03/doc/zachet2b.doc -- 58.0 Кб -- 21.05.2004
Похожие документы
Похожие документы