Материалы к занятию 12 Ключевые слова Гипертекст. HTML (Hyper Text Markup Language) - язык разметки гипертекста. HTML-файл или HTML-страница. XML (Extensible Markup Language) - расширяемый язык разметки. Основные понятия : элемент (контейнер, element), тег(tag), атрибут(attribute), гиперссылка (hyperlink), вложение элементов. Фрейм (frame), апплет(applet), сценарий (script). RGB код. HTML-редакторы (Dreamweaver.).
Материалы к занятию 2 Ключевые слова Бит, байт, кодировки символов. Операционная система - файловая система, драйверы, интерфейс - командная строка, GUI, API.. Файл. Документы и исполняемые файлы(программы). Имя файла и расширение Маска имени. Атрибуты файла. Право доступа. Ассоциация файла, иконка (пиктограмма). Файловая система. Каталог, директория, папка. Полное имя файла, путь к файлу. Логический и физический диск. Оболочка. Оболочка FAR manager. Панель. Меню. Подсказка /Help.
Материалы к занятию 6 Ключевые слова Аминокислотная последовательность (sequence). ... Пространственная структура (3D structure). Рентгеноструктурный анализ (X- ray Сrystallography) и ядерный магнитный резонанс (NMR). Рентгеноструктурный анализ: кристаллы, рентгеновское излучение, рассеивание на электронных облаках, дифракционный метод. ... Брукхейвенский банк данных пространственных структур (PDB). ... Программа визуализации пространственных структур - RasMol. ...
... излучение, рассеивание на |section of polypeptide chain | ... Ангстрем (е). |limits of a residue are indicated by | ... пространственных структур (PDB). |notations for atoms and torsion | angles are indicated. The chain is | ... Cis-, |shown in a fully extended | ... Торзионные углы|conformation (?i = ?i = ?i = 180њ), | Карта Рамачандрана. |and the residue illustrated is L. | Основная цепь белка (полипептидная| | цепь, main chain, backbone). ... спирали и ( -тяжи. ...
... F11>, <F12> - функциональные клавиши; клавиши управления курсором - стрелки, <PgUp> и т.п. <Enter>, <Esc>, <Shift>, <Ctrl>, <Alt>, ., - специальные клавиши клавиши дополнительной клавиатуры (справа, стрелки с цифрами и т.п.) Некоторые действия выполняются одновременным нажатием двух или даже трех клавиш. ... В большинстве Windows-приложений для сохранения текущего состояния документа в новом файле достаточно выполнить действия, описанные ниже. ... Удалить каталог, файл, выделенную группу файлов <F8>...
... Покажите преподавателю, как с помощью одной команды FAR manager Вы можете изменить конфигурацию панели, т.е. сделать описание файлов более или менее подробным. ... Покажите преподавателю, как с помощью одной команды FAR manager Вы можете перевести неактивную панель в режим быстрого просмотра содержимого файла, а затем возвратить панель к первоначальному виду. ... Покажите преподавателю, как с помощью одной команды FAR manager Вы можете сортировать файлы. ...
Названия аминокислот A Ala Alanine Аланин R Arg Arginine Аргинин N Asn Asparagine Аспарагин D Asp Aspartic Acid Аспарагиновая кислота C Cys Cysteine Цистеин Q Gln Glutamine Глутамин E Glu Glutamic Acid Глутаминовая кислота G Gly Glycine Глицин H His Histidine Гистидин I Ile Isoleucine Изолейцин L Leu Leucine Лейцин K Lys Lysine Лизин M Met Methionine ...
... Нажать кнопку включения питания на системном блоке 2. ... Подождать появления предложения нажать <Ctrl+Alt+Del> (ок.2 мин) 4. ... E-mail (OutlookExpress): как послать письмо. ... Нажать кнопку "Create message" в верхнем меню; появится окно для письма. ... Написать адрес в поле "To" 4. В поле "Cc" написать адреса, по которым послать копию письма 5. В поле "Subject" написать тему письма 6. В большом поле написать письмо. ... Нажать кнопку "Send" (верхнее меню окна с письмом) 8. ...
... Элемент - это <TAG attr1="value1" attr2="value2 > text </TAG>, где TAG (тег) - слово, определяющий тип элемента, attr1, attr2 - свойства данного элемента, value1, value2 - значения свойств пример: <A href="http://www.yndex.ru" > поисковая система Yandex</A> 2. ... IMG src="Ссылка на файл" > - элемент для создания ссылки на графический файл, не имеет конечного тега, атрибуты - border, width, height. ... TABLE > - таблица, атрибуты - align, border, bgcolor. ... P> - абзац, атрибуты - align. ...
... Что мы хотим увидеть на второй странице : a) заголовок « Первый семестр»; подзаголовок более мелким шрифтом «Программы, с которыми мы работали: FAR manager, Word, Excel, Internet Explorer, Outlook Express, ACD/ChemSketch, Rasmol »; b) небольшой текст, в котором Вы объясните преподавателям, чему Вы реально научились в течение семестра (понятно, что это не то же самое, чему мы Вас учили); c) гиперссылка на третью ... Что мы хотим увидеть на третьей странице? ...
. Биоинформатика . Семестры . Студенты . Преподаватели . Учебные материалы "Свойства аминокислот" Стандартные названия канонических аминокислот . Структурные формулы канонических аминокислот . "Общепринятое" мнение о свойствах боковых радикалов . Молекулярная масса канонических аминокислот . Разные оценки гидрофобности боковых радикалов . рКа полярных групп в боковых радикалах . Частоты встречаемости аминокислот . Для тех, кому интересно, - полезный адрес
... работа с программой ACD/Chem Sketch . ... NH 2 C 2 H 3 (COOH) 2 . ... 133 атомных единиц массы . Обьем радикала . ... Средних размеров радикал . ... Один из самых гидрофильных радикалов . ... Заряжен. pK 3.9-4.5. ... Строение радикала . ... Это достаточно часто встречающийся остаток в белках, но помимо этого аспарагиновая кислота выполняет множество других разнообразных функций в различных организмах, в частности на ряду с глутаминовой кислотой и глицином служит нейромедиатором в ЦНС. ...
. Пространственная структура . Работа с програмой Rasmol . PDB код - 1lxa . Это глобулярный белок Подолговатой формы , слегка напоминающий пистолет. Лиганд не обнаружен. Карта Рамачандрана . Фрагмент вторичной структуры . Топология домена . Контакты . На главную
... Credit_1 (файл ReadMe с названием семейства и, если нужно, комментариями о том что где лежит) . Texts (содержит Protocol, Referat и др. собственные тексты) . ... msf (выравнивания полных посл-й семейства, отдельных доменов, подсемейств) . Detectors (детекторы семейств и подсемейств) . ... HMM (файлы *.hmm с профилями, *.hmmscan с результатами) . ... 3D (трехмерные структуры белков семейства) . Data (xls таблицы и др. файлы со сводными результатами) . ... Referat.doc . ... FFFF.msf . ...
Credit_1 (файл ReadMe с названием семейства и, если нужно, комментариями о том что где лежит) . ... Fasta (полная выборка посл-й в fasta формате и ничего больше) . msf (выравнивания полных посл-й семейства, отдельных доменов, подсемейств) . ... HMM (файлы *.hmm с профилями, *.hmmscan с результатами) . ... 3D (трехмерные структуры белков семейства) . ... Temp (для промежуточных файлов на сеанс работы; мое правило: садясь за компьютер, из этой моей директории могу удалить все файлы не разбираясь. ...
... Примеры 2. ... Примеры b. Выравнивание последовательностей (или представителей? кого представителей?). c. Доменная структура белков семейства. d. Описание выравнивания "по вертикали" - выделение участков достоверного выравнивания; консервативных участков; консервативных позиций. e. Создание профиля, HMM и/или паттерна для отлова последовательностей семейства ("детекторы семейства") f. Описание "контраста" семейства - насколько его представители отличаются по последовательности от всех других белков....
[
Текст
]
Ссылки http://kodomo.cmm.msu.su/FBB/year_02/term_4/block_1/lecture.doc -- 32.5 Кб -- 10.02.2004 Похожие документы