Поиск по:erg.biophys.msu.ru -
Поискать по всем серверам
На этой странице приведены все страницы сервера erg.biophys.msu.ru ,которые мы индексируем. Показаны документы 1 - 20 из 69.
Упорядочить по:
URL
|
дате изменения
1. comcon1 ERG Research Group: Лаборатория теоретической биофизики
О лаборатории . ... Лаборатория теоретической биофизики . ... Posted by comcon1 in Без рубрики . ... To build topology for the new molecule partial charges for atoms should be determined. ... All-atom automatic OPLS-AA topology generator . ... comcon1 in All-atom automatic OPLS-AA topology? . ... Natallia in All-atom automatic OPLS-AA topology? OPLS-AA? in All-atom automatic OPLS-AA topology? Luge Zhang in All-atom automatic OPLS-AA topology? ... 2009 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/author/comcon1/page/2 -- 27.9 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
2. Peter Mamonov ERG Research Group: Лаборатория теоретической биофизики
О лаборатории . ... Лаборатория теоретической биофизики . ... Posted by Peter Mamonov in Без рубрики . ... ab initio basis sets cp2k education Firefly FRAP GAMESS gromacs MDAnalysis membrane mmb nano OPLS pymol python scipy sparse matrix toolset topology познавательно учебные материалы . OPLS-AA patch for different types of molecules . ... All-atom automatic OPLS-AA topology generator . ... OPLS-AA? in All-atom automatic OPLS-AA topology? ... 2011 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/author/piton/page/2 -- 17.3 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
3. python ERG Research Group: Лаборатория теоретической биофизики
О лаборатории . ... Лаборатория теоретической биофизики . ... Published in Ноябрь 29th, 2011 . ... Download script: memgen-0.0.1.tar.gz System requirements: python 2 (2.6 and higher), python openbabel library, python numpy library. If you are looking for topologies and structure files for lipids please read this post. ... PES scan can be done using linear translations, and rotations of atomic groups. ... OPLS-AA patch for different types of molecules . ... 2011 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/tag/python/page/2 -- 25.6 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
4. sparse matrix ERG Research Group: Лаборатория теоретической биофизики
О лаборатории . ... Лаборатория теоретической биофизики . ... We introduceљthe sparse matrix technique that is rather efficient for computation of certain types of diffusion PDE. continue reading..... ab initio basis sets cp2k education Firefly FRAP GAMESS gromacs MDAnalysis membrane mmb nano OPLS pymol python scipy sparse matrix toolset topology познавательно учебные материалы . OPLS-AA patch for different types of molecules . ... 2016 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/tag/sparse-matrix -- 17.2 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
5. MDAnalysis ERG Research Group: Лаборатория теоретической биофизики
О лаборатории . ... Лаборатория теоретической биофизики . ... Here is the tutorial about how to scan potential energy over specific internal coordinate (e.g. dihedral angle) ab initio and then transfer this trajectory into molecular mechanics package and compare them. continue reading..... ab initio basis sets cp2k education Firefly FRAP GAMESS gromacs MDAnalysis membrane mmb nano OPLS pymol python scipy sparse matrix toolset topology познавательно учебные материалы . ... 2015 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/tag/mdanalysis -- 17.1 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
6. basis sets ERG Research Group: Лаборатория теоретической биофизики
О лаборатории . ... Лаборатория теоретической биофизики . ... The manual to FireFly program clearly explain why and how to use spherical or cartesian functions when working with different basis sets. ... continue reading..... ab initio basis sets cp2k education Firefly FRAP GAMESS gromacs MDAnalysis membrane mmb nano OPLS pymol python scipy sparse matrix toolset topology познавательно учебные материалы . OPLS-AA patch for different types of molecules . ... 2014 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/tag/basis-sets -- 17.3 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
7. comcon1 ERG Research Group: Лаборатория теоретической биофизики
О лаборатории . ... Лаборатория теоретической биофизики . Published in Февраль 8th, 2016 . Posted by comcon1 in Без рубрики . ... ERG group members work with different types of molecules and consequently added new atomtypes into classical OPLS-AA distributed with GROMACS. Now the ERG patch of OPLS-AA force field is published at bitbucket as a repository. continue reading.. ... Published in Май 19th, 2015 . ... comcon1 in All-atom automatic OPLS-AA topology? . ... 2014 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/author/comcon1 -- 30.4 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
8. ab initio ERG Research Group: Лаборатория теоретической биофизики
О лаборатории . ... Лаборатория теоретической биофизики . ... All these data are very helpful for everybody who wants to learn practical quantum chemistry. continue reading..... ab initio basis sets cp2k education Firefly FRAP GAMESS gromacs MDAnalysis membrane mmb nano OPLS pymol python scipy sparse matrix toolset topology познавательно учебные материалы . ... All-atom automatic OPLS-AA topology generator . ... OPLS-AA? in All-atom automatic OPLS-AA topology? ... 2015 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/tag/ab-initio -- 17.1 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
9. education ERG Research Group: Лаборатория теоретической биофизики
О лаборатории . ... Лаборатория теоретической биофизики . ... continue reading..... ab initio basis sets cp2k education Firefly FRAP GAMESS gromacs MDAnalysis membrane mmb nano OPLS pymol python scipy sparse matrix toolset topology познавательно учебные материалы . ... All-atom automatic OPLS-AA topology generator . ... comcon1 in All-atom automatic OPLS-AA topology? . ... OPLS-AA? in All-atom automatic OPLS-AA topology? ... 2012 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/tag/education -- 17.2 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
10. admin ERG Research Group: Лаборатория теоретической биофизики
О лаборатории . ... Лаборатория теоретической биофизики . ... Posted by admin in Без рубрики . ... OPLS-AA topology generation is a very complex task because of huge amount of the atomtypes described this force field. ... All-atom automatic OPLS-AA topology generator . ... comcon1 in All-atom automatic OPLS-AA topology? . ... Natallia in All-atom automatic OPLS-AA topology? OPLS-AA? in All-atom automatic OPLS-AA topology? ... 2008 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/author/admin -- 25.8 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
11. Peter Mamonov ERG Research Group: Лаборатория теоретической биофизики
О лаборатории . ... Лаборатория теоретической биофизики . ... Posted by Peter Mamonov in Без рубрики . ... continue reading.. ... PES scan can be done using linear translations, and rotations of atomic groups. ... Given a molecular object name and QM part selection name (which can be defined using either approach available in PyMol) it generates output file with corresponding input groups. ... 2011 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/author/piton -- 30.7 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
12. topology ERG Research Group: Лаборатория теоретической биофизики
... Лаборатория теоретической биофизики . ... ERG group members work with different types of molecules and consequently added new atomtypes into classical OPLS-AA distributed with GROMACS. ... OPLS-AA topology generation is a very complex task because of huge amount of the atomtypes described this force field. ... All-atom automatic OPLS-AA topology generator . ... comcon1 in All-atom automatic OPLS-AA topology? . ... OPLS-AA? in All-atom automatic OPLS-AA topology? ... 2012 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/tag/topology -- 21.5 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
13. membrane ERG Research Group: Лаборатория теоретической биофизики
О лаборатории . ... Лаборатория теоретической биофизики . ... For lipid bilayer modelling the whole toolchain was built: from creating membranes to MD trajectory analysis. We use OPLS-AA forcefield with Berger potentials for alcane dihedrals integrated. ... All-atom automatic OPLS-AA topology generator . ... comcon1 in All-atom automatic OPLS-AA topology? . ... Natallia in All-atom automatic OPLS-AA topology? OPLS-AA? in All-atom automatic OPLS-AA topology? ... 2011 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/tag/membrane -- 21.1 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
14. Firefly ERG Research Group: Лаборатория теоретической биофизики
О лаборатории . ... Лаборатория теоретической биофизики . ... Posted by comcon1 in Без рубрики . ... PyMol is a powerful drawing instrument and here we show how to plot Fukui function with PyMOL after two calculation steps with FireFly (PC-GAMESS). continue reading.. ... To build topology for the new molecule partial charges for atoms should be determined. ... OPLS-AA patch for different types of molecules . ... comcon1 in All-atom automatic OPLS-AA topology? . ... 2012 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/tag/firefly -- 25.3 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
15. toolset ERG Research Group: Лаборатория теоретической биофизики
О лаборатории . ... Лаборатория теоретической биофизики . ... Download script: memgen-0.0.1.tar.gz System requirements: python 2 (2.6 and higher), python openbabel library, python numpy library. ... continue reading..... ab initio basis sets cp2k education Firefly FRAP GAMESS gromacs MDAnalysis membrane mmb nano OPLS pymol python scipy sparse matrix toolset topology познавательно учебные материалы . OPLS-AA patch for different types of molecules . ... 2011 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/tag/toolset -- 26.0 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
16. gromacs ERG Research Group: Лаборатория теоретической биофизики
О лаборатории . ... Лаборатория теоретической биофизики . ... OPLS-AA topology generation is a very complex task because of huge amount of the atomtypes described this force field. ... We use OPLS-AA with some includings; ?includings? are overlays on the standart GROMACS forcefield files. ... All-atom automatic OPLS-AA topology generator . ... comcon1 in All-atom automatic OPLS-AA topology? . ... OPLS-AA? in All-atom automatic OPLS-AA topology? ... 2011 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/tag/gromacs -- 26.3 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
17. python ERG Research Group: Лаборатория теоретической биофизики
О лаборатории . ... Лаборатория теоретической биофизики . Published in Январь 24th, 2016 . Posted by admin in Без рубрики . ... In this article we considerљcalculationљof discrete Laplacian for 1D arrays usingљpython/numpy/scipy. We introduceљthe sparse matrix technique that is rather efficient for computation of certain types of diffusion PDE. continue reading.. Published in Май 19th, 2015 . Posted by comcon1 in Без рубрики . ... continue reading.. ... 2012 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/tag/python -- 31.0 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
18. GAMESS ERG Research Group: Лаборатория теоретической биофизики
О лаборатории . ... Лаборатория теоретической биофизики . ... To build topology for the new molecule partial charges for atoms should be determined. ... OPLS-AA patch for different types of molecules . ... All-atom automatic OPLS-AA topology generator . ... comcon1 in All-atom automatic OPLS-AA topology? . ... Natallia in All-atom automatic OPLS-AA topology? OPLS-AA? in All-atom automatic OPLS-AA topology? Luge Zhang in All-atom automatic OPLS-AA topology? ... 2011 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/tag/gamess -- 22.8 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
19. scipy ERG Research Group: Лаборатория теоретической биофизики
О лаборатории . ... Лаборатория теоретической биофизики . ... In this article we considerљcalculationљof discrete Laplacian for 1D arrays usingљpython/numpy/scipy. ... All-atom automatic OPLS-AA topology generator . ... comcon1 in All-atom automatic OPLS-AA topology? . ... Natallia in All-atom automatic OPLS-AA topology? OPLS-AA? in All-atom automatic OPLS-AA topology? Luge Zhang in All-atom automatic OPLS-AA topology? ... 2016 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/tag/scipy -- 17.2 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
20. pymol ERG Research Group: Лаборатория теоретической биофизики
О лаборатории . ... Лаборатория теоретической биофизики . ... PyMol is a powerful drawing instrument and here we show how to plot Fukui function with PyMOL after two calculation steps with FireFly (PC-GAMESS). continue reading.. ... Given a molecular object name and QM part selection name (which can be defined using either approach available in PyMol) it generates output file with corresponding input groups. ... All-atom automatic OPLS-AA topology generator . ... 2011 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/tag/pymol -- 25.9 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы