Поиск по:kodomo.fbb.msu.ru -
Поискать по всем серверам
На этой странице приведены все страницы сервера kodomo.fbb.msu.ru ,которые мы индексируем. Показаны документы 101 - 120 из 117625.
Упорядочить по:
URL
|
дате изменения
101. allpy: utils/realign_block.py history
. log . graph . tags . bookmarks . branches . changeset . browse . file . diff . annotate . file log . raw . help . find changesets by author, revision, files, or words in the commit message . less more | (0) tip . age . author . description . Tue, 15 Feb 2011 20:29:48 +0300 . Daniil Alexeyevsky . Added util realign_block (almost exact copy of flush_left) base utils/flush_left.py@84e88cbab82a . less more | (0) tip
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/log/tip/utils/realign_block.py -- 4.4 Кб -- 12.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
102. allpy: b556c96c6719 /blocks3d/wt/
... find changesets by author, revision, files, or words in the commit message . ... drwxr-xr-x . files/ css . ... rw-r--r-- . ... 106 . ... blocks3d-wt-widget.C . ... blocks3d-wt.C . ... blocks3d-wt.pro . ... rwxr-xr-x . ... 103 . ... 1020 . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/file/b556c96c6719/blocks3d/wt -- 7.1 Кб -- 12.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
103. allpy: b556c96c6719 /docs/source/
. log . graph . tags . bookmarks . branches . changeset . browse . help . find changesets by author, revision, files, or words in the commit message . name . size . permissions . [up] . drwxr-xr-x . allpy/ . drwxr-xr-x . conf.py . 6291 . -rw-r--r-- . index.rst . 436 . -rw-r--r--
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/file/b556c96c6719/docs/source -- 3.7 Кб -- 12.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
104. allpy: f1c6ed49f7e0 /blocks3d/wt/
... find changesets by author, revision, files, or words in the commit message . ... drwxr-xr-x . files/ css . ... rw-r--r-- . ... 106 . ... blocks3d-wt-widget.C . ... blocks3d-wt.C . ... blocks3d-wt.pro . ... rwxr-xr-x . ... 103 . ... 1020 . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/file/f1c6ed49f7e0/blocks3d/wt -- 7.1 Кб -- 12.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
105. allpy: f1c6ed49f7e0 /docs/source/
. log . graph . tags . bookmarks . branches . changeset . browse . help . find changesets by author, revision, files, or words in the commit message . name . size . permissions . [up] . drwxr-xr-x . allpy/ . drwxr-xr-x . conf.py . 6291 . -rw-r--r-- . index.rst . 436 . -rw-r--r--
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/file/f1c6ed49f7e0/docs/source -- 3.6 Кб -- 12.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
106. allpy: utils/extract_pfam.py history
... Fri, 15 Jul 2011 17:13:01 +0400 . Daniil Alexeyevsky . ... Thu, 14 Jul 2011 16:19:07 +0400 . ... Added option --pdb-cache to extract_pfam.py . ... Moved SequencePdbResiMarkup to allpy.markups, since it is used frequently . Wed, 13 Jul 2011 18:01:42 +0400 . ... extract_pfam: added command line options for everything (closes #80) . ... Tue, 12 Jul 2011 17:56:43 +0400 . ... extract_pfam: fixed paths for Pfam . ... Mon, 11 Jul 2011 18:27:37 +0400 . ... Added util extract_pfam . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/log/tip/utils/extract_pfam.py -- 10.7 Кб -- 12.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
107. allpy: debian/blocks3d.links history
. log . graph . tags . bookmarks . branches . changeset . browse . file . diff . annotate . file log . raw . help . find changesets by author, revision, files, or words in the commit message . less more | (0) tip . age . author . description . Wed, 02 Nov 2011 19:42:48 +0300 . Daniil Alexeyevsky . Fixed symlink in blocks3d debian package . Sun, 20 Feb 2011 20:47:50 +0300 . Daniil Alexeyevsky . Debianized blocks3d, blocks3d-wt; fixed debian dependencies for python-allpy where necessary . less more | (0) tip
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/log/tip/debian/blocks3d.links -- 4.5 Кб -- 12.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
108. allpy: b556c96c6719 utils/protein_pdb.py
. log . graph . tags . branches . changeset . browse . file . latest . diff . annotate . file log . raw . help . find changesets by author, revision, files, or words in the commit message . blocks3d/www Makefile: never check certificates of github, they are too confusing for wget . author . Daniil Alexeyevsky <dendik@kodomo.fbb.msu.ru> . date . Mon, 26 May 2014 17:20:29 +0400 . parents . 6c6ae5013ab6 . children . line source . 1 ../ blocks3d / protein_pdb . py .
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/file/tip/utils/protein_pdb.py -- 4.1 Кб -- 12.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
109. allpy: b556c96c6719 test/test_silence.py
... 1 """Test for allpy.util.Silence . ... 3 >>> print check_output(["python", __file__], stderr=STDOUT) . ... 5 Stdout must be seen (only stderr silenced) . ... 56 print "Stdout must be seen (only stderr silenced)" . ... 62 print "Stdout must not be seen (both silenced)" . ... 76 check_call ([ "echo" , "Stdout must be seen (only stderr silenced)" ]) . 77 check_call ([ "echo" , "Stderr must not be seen" ], stdout = sys . ... 89 check_call ([ "echo" , "Stderr must be seen too" ], stdout = sys . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/file/tip/test/test_silence.py -- 19.9 Кб -- 12.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
110. allpy: b556c96c6719 test/test_realign.py
... 1 from allpy import protein , processors . ... 3 example1 = ( protein . ... 4 append_row_from_string ( "rrrgggfff---" , name = "abc" ) . ... 7 def test_simple (): . ... 9 example1 . realign ( processors . ... rows_as_strings () == [ "RRRGGGFFF---" , "MMMRRRFFF---" ] . ... 16 def test_muscle (): . ... 21 def test_needle (): . ... 26 def test_realign_block (): . 27 """Test what happens when we realign a block.""" . ... 38 def test_muscle_duplicate (): . ... 42 def test_needle_duplicate (): . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/file/tip/test/test_realign.py -- 16.1 Кб -- 12.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
111. allpy: b556c96c6719 test/test_markups.py
... file . ... 2 from allpy import base . ... 4 from allpy import markups . ... 7 def test_index (): . 8 seq = protein . ... 9 markup = seq . add_markup ( 'index' ) . 10 assert seq [ 5 ] . ... 11 assert markup [ seq [ 5 ]] == 5 . ... 14 aln = protein . ... 15 markup = aln . ... to_file ( file , format = "markup" ) . ... append_file ( file , format = "markup" ) . 23 assert str ( aln . ... 24 assert aln . ... add_markup ( 'number' ) . ... add_markup ( 'ss' , markup_class = markups . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/file/tip/test/test_markups.py -- 51.0 Кб -- 12.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
112. allpy: b556c96c6719 pair_cores/mkhtml.py
... find changesets by author, revision, files, or words in the commit message . ... author . ... 3 import os . 4 import json . 5 import sys . ... 7 from protein_pdb import Alignment , Block , Sequence . 8 from html import html_template . ... 10 fasta_file = sys . argv [ 1 ] . 11 blocks_file = sys . ... 13 alignment = Alignment () . append_file ( open ( fasta_file )) . 14 blocks = alignment . blocks_from_file ( open ( blocks_file )) . 15 alignment . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/file/tip/pair_cores/mkhtml.py -- 7.0 Кб -- 12.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
113. allpy: b556c96c6719 blocks3d/blocks3d.py
... file . ... file log . ... help . ... blocks3d/www Makefile: never check certificates of github, they are too confusing for wget . ... add_argument ( '-i' , help = 'Input alignment file' , metavar = 'FILE' , type = r , required = True ) . ... add_argument ( '-c' , help = 'PDB names conformity file' , metavar = 'FILE' , type = r ) . ... add_argument ( '-o' , help = 'Output text file' , metavar = 'FILE' , type = w ) . ... add_argument ( '-H' , help = 'Output html file' , metavar = 'FILE' , type = w ) ....
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/file/tip/blocks3d/blocks3d.py -- 22.6 Кб -- 12.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
114. allpy: utils/pool diff
. log . graph . tags . bookmarks . branches . changeset . browse . file . latest . diff . annotate . file log . raw . help . find changesets by author, revision, files, or words in the commit message . blocks3d/www Makefile: never check certificates of github, they are too confusing for wget . author . Daniil Alexeyevsky <dendik@kodomo.fbb.msu.ru> . date . Mon, 26 May 2014 17:20:29 +0400 . parents . children . line diff .
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/diff/b556c96c6719/utils/pool -- 3.6 Кб -- 12.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
115. allpy: b556c96c6719 utils/pool
... help . ... 2 import subprocess . 3 import os . 4 import shlex . 5 import optparse . ... add_option ( '-n' , '--size' , type = int , help = 'Pool size' ) . ... add_option ( '-c' , '--cmd' , . 10 help = 'Command template. ... 12 options , args = p . ... 14 spawned = 0 . ... 16 if spawned > options . size : . ... 19 cmd = shlex . split ( options . cmd . ... Popen ( cmd ) . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/file/b556c96c6719/utils/pool -- 8.9 Кб -- 12.04.2016
[ Сохраненная копия ] Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/file/tip/utils/pool -- 8.9 Кб -- 12.04.2016
Похожие документы
[ Сохраненная копия ] Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/file/tip/utils/pool -- 8.9 Кб -- 12.04.2016
Похожие документы
116. allpy: b556c96c6719 /allpy/data/
. log . graph . tags . bookmarks . branches . changeset . browse . help . find changesets by author, revision, files, or words in the commit message . name . size . permissions . [up] . drwxr-xr-x . monomers/ . drwxr-xr-x . Makefile . 183 . -rw-r--r-- . __init__.py . 76 . -rw-r--r-- . blossum62.py . 5389 . -rw-r--r-- . genetic_code.py . 1447 . -rw-r--r-- . mkcodes.py . 4418 . -rwxr-xr-x
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/file/b556c96c6719/allpy/data -- 4.5 Кб -- 12.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
117. allpy: f1c6ed49f7e0 /allpy/data/
. log . graph . tags . bookmarks . branches . changeset . browse . help . find changesets by author, revision, files, or words in the commit message . name . size . permissions . [up] . drwxr-xr-x . monomers/ . drwxr-xr-x . Makefile . 183 . -rw-r--r-- . __init__.py . 76 . -rw-r--r-- . blossum62.py . 5389 . -rw-r--r-- . genetic_code.py . 1447 . -rw-r--r-- . mkcodes.py . 4418 . -rwxr-xr-x
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/file/f1c6ed49f7e0/allpy/data -- 4.4 Кб -- 12.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
118. allpy: utils/protein_pdb.py history
. log . graph . tags . bookmarks . branches . changeset . browse . file . diff . annotate . file log . raw . help . find changesets by author, revision, files, or words in the commit message . less more | (0) tip . age . author . description . Tue, 25 Oct 2011 21:47:56 +0300 . Boris Nagaev . add program extract_prefab.py base pair_cores/protein_pdb.py@a096c49ef3cd . less more | (0) tip
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/log/tip/utils/protein_pdb.py -- 4.3 Кб -- 12.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
119. allpy: test/test_silence.py history
. log . graph . tags . bookmarks . branches . changeset . browse . file . diff . annotate . file log . raw . help . find changesets by author, revision, files, or words in the commit message . less more | (0) tip . age . author . description . Fri, 01 Jun 2012 13:43:02 +0400 . Daniil Alexeyevsky . Added allpy.util.Silence to faciliate running most code with as little noise as possible . less more | (0) tip
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/log/tip/test/test_silence.py -- 4.2 Кб -- 12.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
120. allpy: test/test_realign.py history
... Sat, 09 Jun 2012 19:15:44 +0400 . Daniil Alexeyevsky . ... Sun, 03 Jun 2012 12:09:41 +0400 . ... Reorganized tests to make them more readable . Wed, 30 May 2012 13:35:04 +0400 . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/log/tip/test/test_realign.py -- 5.3 Кб -- 12.04.2016
Похожие документы
Похожие документы