Поиск по:erg.biophys.msu.ru -
Поискать по всем серверам
На этой странице приведены все страницы сервера erg.biophys.msu.ru ,которые мы индексируем. Показаны документы 21 - 40 из 69.
Упорядочить по:
URL
|
дате изменения
21. OPLS ERG Research Group: Лаборатория теоретической биофизики
... Лаборатория теоретической биофизики . ... ERG group members work with different types of molecules and consequently added new atomtypes into classical OPLS-AA distributed with GROMACS. ... OPLS-AA topology generation is a very complex task because of huge amount of the atomtypes described this force field. ... All-atom automatic OPLS-AA topology generator . ... comcon1 in All-atom automatic OPLS-AA topology? . ... OPLS-AA? in All-atom automatic OPLS-AA topology? ... 2015 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/tag/opls -- 18.6 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
22. FRAP ERG Research Group: Лаборатория теоретической биофизики
О лаборатории . ... Лаборатория теоретической биофизики . ... FRAP kinetics can be measured from image series directly with numpy libraries. ... continue reading..... ab initio basis sets cp2k education Firefly FRAP GAMESS gromacs MDAnalysis membrane mmb nano OPLS pymol python scipy sparse matrix toolset topology познавательно учебные материалы . ... All-atom automatic OPLS-AA topology generator . ... OPLS-AA? in All-atom automatic OPLS-AA topology? ... 2015 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/tag/frap -- 17.3 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
23. nano ERG Research Group: Лаборатория теоретической биофизики
О лаборатории . ... Лаборатория теоретической биофизики . ... continue reading..... ab initio basis sets cp2k education Firefly FRAP GAMESS gromacs MDAnalysis membrane mmb nano OPLS pymol python scipy sparse matrix toolset topology познавательно учебные материалы . ... All-atom automatic OPLS-AA topology generator . ... comcon1 in All-atom automatic OPLS-AA topology? . ... OPLS-AA? in All-atom automatic OPLS-AA topology? ... 2011 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/tag/nano -- 18.7 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
24. cp2k ERG Research Group: Лаборатория теоретической биофизики
О лаборатории . ... Лаборатория теоретической биофизики . ... continue reading..... ab initio basis sets cp2k education Firefly FRAP GAMESS gromacs MDAnalysis membrane mmb nano OPLS pymol python scipy sparse matrix toolset topology познавательно учебные материалы . ... All-atom automatic OPLS-AA topology generator . ... comcon1 in All-atom automatic OPLS-AA topology? . ... OPLS-AA? in All-atom automatic OPLS-AA topology? ... 2011 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/tag/cp2k -- 18.7 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
25. mmb ERG Research Group: Лаборатория теоретической биофизики
О лаборатории . ... Лаборатория теоретической биофизики . ... continue reading..... ab initio basis sets cp2k education Firefly FRAP GAMESS gromacs MDAnalysis membrane mmb nano OPLS pymol python scipy sparse matrix toolset topology познавательно учебные материалы . ... All-atom automatic OPLS-AA topology generator . ... comcon1 in All-atom automatic OPLS-AA topology? . ... OPLS-AA? in All-atom automatic OPLS-AA topology? ... 2012 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/tag/mmb -- 17.0 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
26. Using spherical functions (from A.Granovsky manual) ERG Research Group:
О лаборатории . ... Лаборатория теоретической биофизики . ... The manual to FireFly program clearly explain why and how to use spherical or cartesian functions when working with different basis sets. ... The $D5 group provides further control through the D5, F7, and G9 keywords, which pertain to d, f, and g functions, respectively. ... Quantum chemistry information page ERG Research Group: Лаборатория теоретической биофизики написал (Май 19th, 2015 5:52 пп) . ... 2014 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/557 -- 23.4 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
27. OPLS-AA patch for different types of molecules ERG Research Group: Лаборатория
О лаборатории . ... Лаборатория теоретической биофизики . ... ERG group members work with different types of molecules and consequently added new atomtypes into classical OPLS-AA distributed with GROMACS. Now the ERG patch of OPLS-AA force field is published at bitbucket as a repository. ... Нет комментариев " OPLS-AA patch for different types of molecules " . ... OPLS-AA patch for different types of molecules . ... OPLS-AA? in All-atom automatic OPLS-AA topology? ... 2016 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/777 -- 22.1 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
28. Reaction-diffusion systems in 2D space with python ERG Research Group:
О лаборатории . ... Лаборатория теоретической биофизики . ... In our previous article (<a href=? http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/706 ? ... Here we generalize this technique for the two-dimensional space. ... Let us demonstrate how the discrete Laplacian is used in explicit scheme of solving the reaction-diffusion system . ... Нет комментариев " Reaction-diffusion systems in 2D space with python " . ... Reaction-diffusion systems in 2D space with python . ... 2016 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/747 -- 31.7 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
29. Constructing discrete Laplacian via sparse matrix ERG Research Group:
... In this article we consider calculation of discrete Laplacian for 1D arrays using python/numpy/scipy. We introduce the sparse matrix technique that is rather efficient for computation of certain types of diffusion PDE. ... 1 комментарий " Constructing discrete Laplacian via sparse matrix " . Reaction-diffusion systems in 2D space with python ERG Research Group: Лаборатория теоретической биофизики написал (Январь 26th, 2016 2:13 пп) . ... Constructing discrete Laplacian via sparse matrix . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/706 -- 34.7 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
30. Scanning PES ab initio and in MM ERG Research Group: Лаборатория теоретической
О лаборатории . ... Лаборатория теоретической биофизики . ... Here orig1 is the starting value of internal coordinate and zero corresponds to this value in current geometry. disp1 means step of scanning (degrees for angles and Angstroms for bonds). ndisp1 points number of steps in PES scan. vect1 ? ... Нет комментариев " Scanning PES ab initio and in MM " . ... OPLS-AA patch for different types of molecules . ... Scanning PES ab initio and in MM . ... 2015 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/656 -- 26.6 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
31. Quantum chemistry information page ERG Research Group: Лаборатория
О лаборатории . ... Лаборатория теоретической биофизики . ... On this page we collect references to our resources, documentation and resources on other sites. All these data are very helpful for everybody who wants to learn practical quantum chemistry. Firefly (PC GAMESS) main page . ... ERG group wrote some articles about visualization: . ... Нет комментариев " Quantum chemistry information page " . ... Quantum chemistry information page . ... 2015 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/653 -- 22.7 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
32. Python script for processing FRAP image set ERG Research Group: Лаборатория
... Лаборатория теоретической биофизики . ... FRAP kinetics can be measured from image series directly with numpy libraries. ... Here we provide script that helps you to remove sample motion and obtain FRAP kinetics from image series with console script. ... Here oribl is a small image and _im is full image. ... Нет комментариев " Python script for processing FRAP image set " . ... Python script for processing FRAP image set . ... 2015 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/644 -- 23.8 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
33. Building and plotting Fukui function with FireFly and PyMol ERG Research Group:
... PyMol is a powerful drawing instrument and here we show how to plot Fukui function with PyMOL after two calculation steps with FireFly (PC-GAMESS). ... Because total HOMO orbital have two electrons and should be divided by two (see equations at the beginning). 1 комментарий " Building and plotting Fukui function with FireFly and PyMol " . Quantum chemistry information page ERG Research Group: Лаборатория теоретической биофизики написал (Май 20th, 2015 12:43 пп) . ... 2014 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/591 -- 29.7 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
34. Using Firefly/GAMESS-US efficiently ERG Research Group: Лаборатория
О лаборатории . ... Лаборатория теоретической биофизики . ... 1 комментарий " Using Firefly/GAMESS-US efficiently " . Scanning PES ab initio and in MM ERG Research Group: Лаборатория теоретической биофизики написал (Май 19th, 2015 9:36 пп) . ... OPLS-AA patch for different types of molecules . ... Using Firefly/GAMESS-US efficiently . ... OPLS-AA? in All-atom automatic OPLS-AA topology? ... Scannin? in Using Firefly/GAMESS-US efficiently? 2015 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/581 -- 27.3 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
35. Visualize partial charges in PyMol ERG Research Group: Лаборатория
О лаборатории . ... Лаборатория теоретической биофизики . ... Here we provide some instructions that will allow you to make your own visualization using powerful abilities of PyMol. Below you can find step-by-step instruction of how to visualize partial charges or other atomic information. ... Partial charge? All charges will appear near all atoms! ... Нет комментариев " Visualize partial charges in PyMol " . ... Visualize partial charges in PyMol . ... 2014 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/570 -- 24.5 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
36. PyMol script for scanning potential energy surfaces ERG Research Group:
... Лаборатория теоретической биофизики . ... This PyMol script is capable of generating a set of a molecule?s conformations, which can be further used to calculate their potential energy or any other properties. The script enables one to vary several internal degrees of freedom (DOFs) synchronously as well as scanning over a multidimensional grid in a space of DOFs. ... Нет комментариев " PyMol script for scanning potential energy surfaces " . ... 2013 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/502 -- 30.2 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
37. Pymol compilation with VMD Molfile plugins ERG Research Group: Лаборатория
О лаборатории . ... Лаборатория теоретической биофизики . ... Some distributives (gentoo, openSuse, etc.) contains default Pymol without vmd molfile plugins. ... Download pymol sources from sourceforge: pymol-1.4.1 . ... Open file setup.py and uncomment everything related to VMD molfile. ... Нет комментариев " Pymol compilation with VMD Molfile plugins " . ... Building and plotting Fukui function with FireFly and PyMol . Visualize partial charges in PyMol . ... 2013 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/399 -- 20.8 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
38. Using RESP with GAMESS-US and Firefly (PC-GAMESS) ERG Research Group:
О лаборатории . ... Лаборатория теоретической биофизики . ... Here the guide to use RESP technique based on calculations from Firefly or GAMESS-US is presented. ... Note, that RESP algorythm will fit potential in the set of points which are selected according to $PDC group in the input-file. ... Нет комментариев " Using RESP with GAMESS-US and Firefly (PC-GAMESS) " . ... Using Firefly/GAMESS-US efficiently . ... Scannin? in Using Firefly/GAMESS-US efficiently? 2012 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/351 -- 26.1 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
39. Phase plane explorer ERG Research Group: Лаборатория теоретической биофизики
О лаборатории . ... Лаборатория теоретической биофизики . ... This small program named TRAX is capable of solving systems of ordinary differential equations and plotting the solution on a phase plane as well as function of time. ... 1 комментарий " Phase plane explorer " . ... OPLS-AA patch for different types of molecules . ... All-atom automatic OPLS-AA topology generator . ... OPLS-AA? in All-atom automatic OPLS-AA topology? ... 2012 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/330 -- 20.9 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
40. plotting bifurcation diagram with pylab ERG Research Group: Лаборатория
О лаборатории . ... Лаборатория теоретической биофизики . ... Plotting bifurcation diagram of the following map using pylab . ... Нет комментариев " plotting bifurcation diagram with pylab " . ... Building and plotting Fukui function with FireFly and PyMol . ... Quantum? in Building and plotting Fukui functio? ... 2012 ERG Research Group . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://erg.biophys.msu.ru/wordpress/archives/310 -- 21.9 Кб -- 09.04.2016
Похожие документы
Похожие документы