Поиск по:kodomo.fbb.msu.ru -
Поискать по всем серверам
На этой странице приведены все страницы сервера kodomo.fbb.msu.ru ,которые мы индексируем. Показаны документы 41 - 60 из 117625.
Упорядочить по:
URL
|
дате изменения
41. allpy: utils/freqs.py diff
. log . graph . tags . bookmarks . branches . changeset . browse . file . latest . diff . annotate . file log . raw . help . find changesets by author, revision, files, or words in the commit message . blocks3d/www Makefile: never check certificates of github, they are too confusing for wget . author . Daniil Alexeyevsky <dendik@kodomo.fbb.msu.ru> . date . Mon, 26 May 2014 17:20:29 +0400 . parents . 8c7e5c16b2f4 . children . line diff .
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/diff/b556c96c6719/utils/freqs.py -- 3.7 Кб -- 13.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
42. allpy: test/ex2.fasta diff
. log . graph . tags . bookmarks . branches . changeset . browse . file . latest . diff . annotate . file log . raw . help . find changesets by author, revision, files, or words in the commit message . blocks3d/www Makefile: never check certificates of github, they are too confusing for wget . author . Daniil Alexeyevsky <dendik@kodomo.fbb.msu.ru> . date . Mon, 26 May 2014 17:20:29 +0400 . parents . children . line diff .
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/diff/b556c96c6719/test/ex2.fasta -- 3.7 Кб -- 13.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
43. allpy: allpy/graph.py diff
. log . graph . tags . bookmarks . branches . changeset . browse . file . latest . diff . annotate . file log . raw . help . find changesets by author, revision, files, or words in the commit message . blocks3d/www Makefile: never check certificates of github, they are too confusing for wget . author . Daniil Alexeyevsky <dendik@kodomo.fbb.msu.ru> . date . Mon, 26 May 2014 17:20:29 +0400 . parents . 53690e470eff . children . line diff .
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/diff/b556c96c6719/allpy/graph.py -- 3.7 Кб -- 13.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
44. allpy: utils/pool annotate
... annotate . ... help . ... dendik@799 . ... 2 import subprocess . ... 3 import os . ... 4 import shlex . ... 5 import optparse . ... add_option ( '-n' , '--size' , type = int , help = 'Pool size' ) . ... add_option ( '-c' , '--cmd' , . ... 10 help = 'Command template. ... 12 options , args = p . ... 14 spawned = 0 . ... 16 if spawned > options . ... 19 cmd = shlex . split ( options . cmd . ... Popen ( cmd ) . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/annotate/b556c96c6719/utils/pool -- 15.1 Кб -- 13.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
45. allpy: b556c96c6719 /pair_cores/web/
. log . graph . tags . bookmarks . branches . changeset . browse . help . find changesets by author, revision, files, or words in the commit message . name . size . permissions . [up] . drwxr-xr-x . approot/ locales . drwxr-xr-x . docroot/ css . drwxr-xr-x . Makefile . 1341 . -rw-r--r-- . README.rst . 1023 . -rw-r--r-- . compare-aln-3d.cpp . 4657 . -rw-r--r-- . config.hpp . 108 . -rw-r--r-- . pair-cores.cpp . 8240 . -rw-r--r-- . run-compare.sh . 107 . -rw-r--r-- . run.sh . 103 . -rw-r--r--
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/file/b556c96c6719/pair_cores/web -- 5.4 Кб -- 13.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
46. allpy: b556c96c6719 utils/freqs.py
... 4 from allpy import protein . 5 from allpy.data import codes . ... 10 def freq ( monomer ): . 11 amount = freqs . get ( monomer ) . 12 if amount : . ... 16 aln = protein . ... 17 monomers = [ code1 for code1 , modified , _ , _ in codes . ... 18 monomers += [ "-" ] . ... join ( map ( str , monomers )) . ... 23 for monomer in column : . 24 if monomer : . 25 monomer = monomer . code1 . ... 28 freqs [ monomer ] = freqs . ... join ( map ( str , map ( freq , monomers ))) . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/file/b556c96c6719/utils/freqs.py -- 10.2 Кб -- 13.04.2016
[ Сохраненная копия ] Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/file/tip/utils/freqs.py -- 10.2 Кб -- 13.04.2016
Похожие документы
[ Сохраненная копия ] Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/file/tip/utils/freqs.py -- 10.2 Кб -- 13.04.2016
Похожие документы
47. allpy: b556c96c6719 allpy/graph.py
... graph . ... 23 >>> g.fast_cliques() . ... 40 def copy ( self ): . ... 55 def drop_vertex ( self , vertex ): . ... 63 def vertex_weight ( self , vertex ): . ... 67 def vertex_index ( self , vertex ): . ... 70 def add_vertex ( self , vertex , parent_graph ): . ... 99 def __init__ ( call , candidates , used , compsub ): . ... 104 def get_v_from_candidates ( call ): . ... 108 def used_candidates ( call ): . ... 118 def __call__ ( call ): . ... 164 def expand_to_max_clique ( self , parent_graph ): . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/file/b556c96c6719/allpy/graph.py -- 57.6 Кб -- 13.04.2016
[ Сохраненная копия ] Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/file/tip/allpy/graph.py -- 57.6 Кб -- 13.04.2016
Похожие документы
[ Сохраненная копия ] Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/file/tip/allpy/graph.py -- 57.6 Кб -- 13.04.2016
Похожие документы
48. allpy: b556c96c6719 test/ex2.fasta
log . ... file . ... file log . ... find changesets by author, revision, files, or words in the commit message . ... author . ... PDBID | CHAIN | SEQUENCE . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/file/b556c96c6719/test/ex2.fasta -- 4.9 Кб -- 13.04.2016
[ Сохраненная копия ] Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/file/tip/test/ex2.fasta -- 4.9 Кб -- 13.04.2016
Похожие документы
[ Сохраненная копия ] Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/file/tip/test/ex2.fasta -- 4.9 Кб -- 13.04.2016
Похожие документы
49. allpy: f1c6ed49f7e0 /pair_cores/web/
. log . graph . tags . bookmarks . branches . changeset . browse . help . find changesets by author, revision, files, or words in the commit message . name . size . permissions . [up] . drwxr-xr-x . approot/ locales . drwxr-xr-x . docroot/ css . drwxr-xr-x . Makefile . 1341 . -rw-r--r-- . README.rst . 1023 . -rw-r--r-- . compare-aln-3d.cpp . 4657 . -rw-r--r-- . config.hpp . 108 . -rw-r--r-- . pair-cores.cpp . 8240 . -rw-r--r-- . run-compare.sh . 107 . -rw-r--r-- . run.sh . 103 . -rw-r--r--
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/file/f1c6ed49f7e0/pair_cores/web -- 5.3 Кб -- 13.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
50. allpy: debian/python-allpy.docs history
. log . graph . tags . bookmarks . branches . changeset . browse . file . diff . annotate . file log . raw . help . find changesets by author, revision, files, or words in the commit message . less more | (0) tip . age . author . description . Sun, 20 Feb 2011 20:47:50 +0300 . Daniil Alexeyevsky . Debianized blocks3d, blocks3d-wt; fixed debian dependencies for python-allpy where necessary . less more | (0) tip
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/log/tip/debian/python-allpy.docs -- 4.3 Кб -- 13.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
51. allpy: pair_cores/pair_cores.py history
... Fri, 21 Dec 2012 15:07:05 +0400 . Boris Nagaev . pair_cores: add error messages to rethrown exceptions . Sat, 02 Jun 2012 19:33:42 +0400 . ... Thu, 17 May 2012 01:49:47 +0400 . ... Tue, 03 Apr 2012 12:25:56 +0400 . ... Tue, 20 Mar 2012 01:39:28 +0400 . ... Mon, 19 Mar 2012 15:22:32 +0400 . ... pair-cores: add a patch upgrading allpy.structure 1.4.2 . ... Wed, 14 Mar 2012 17:54:01 +0400 . ... pair_cores.py: add -w option (min_width) . ... Fri, 21 Oct 2011 13:48:47 +0300 . ... boris . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/log/tip/pair_cores/pair_cores.py -- 13.7 Кб -- 13.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
52. allpy: debian/blocks3d-wt.links history
... Tue, 22 Feb 2011 17:16:56 +0300 . Daniil Alexeyevsky . blocks3d-wt: reorganized apache configs for more stable operation . Sun, 20 Feb 2011 22:19:16 +0300 . ... blocks3d-wt debianization: fixed urls for various resources (js & css) . ... Debianized blocks3d, blocks3d-wt; fixed debian dependencies for python-allpy where necessary . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/log/tip/debian/blocks3d-wt.links -- 4.8 Кб -- 13.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
53. allpy: b556c96c6719 utils/markup_to_html.py
... file . ... 6 import sys . ... 9 from allpy import protein . ... modules [ __name__ ] . ... 15 parser = optparse . OptionParser ( description = __doc__ , usage = "%prog [options] [infile]" ) . ... add_option ( "-t" , "--template-file" , default = template_file , . ... add_option ( "-p" , "--import-path" , default = "." , . ... add_option ( "-m" , "--import-module" , . ... 24 options , args = parser . ... import_module : . ... 35 module = __import__ ( options . ... 39 def repr_items ( items ): . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/file/tip/utils/markup_to_html.py -- 18.7 Кб -- 13.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
54. allpy: b556c96c6719 utils/markup_to_file.py
... 6 from allpy import protein , markups , util . ... 8 def add_markup ( alignment , sequence , markup ): . ... name = "markup_{0}|{1}" . ... open ( options . ... markups or markup . ... 37 parser = optparse . ... add_option ( "--input-format" , default = "markup" , . ... add_option ( "-m" , "--markups" , "--markup" , . 47 help = "Optional comma (,) separated list of sequence markups to convert" ) . 48 options , args = parser . ... markups = options . ... 60 arg = arg [: - len ( ".markup" )] . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/file/tip/utils/markup_to_file.py -- 21.0 Кб -- 13.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
55. allpy: b556c96c6719 utils/extract_prefab.py
... help . ... 3 import os . ... 5 import glob . ... 11 from allpy.structure import CachedDownloadPdb . 12 from allpy.util import Binder . ... 14 def fasta2markup ( fasta , ref_dir , out_dir , suffix , cache_dir ): . ... 29 def extract_prefab ( ref_dir , out_dir , suffix , cache_dir , workers ): . ... append ( Binder ( fasta2markup , fasta , ref_dir , out_dir , suffix , cache_dir )) . ... add_argument ( '-w' , '--workers' , help = 'Number of workers (0 = cpu count)' , type = int , default = 0 ) . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/file/tip/utils/extract_prefab.py -- 18.4 Кб -- 13.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
56. allpy: b556c96c6719 pair_cores/score-all.py
... help . ... 8 from allpy.homology import MonomerHomology as H . ... 10 def score_all ( base_dir , pair_cores , case , no_case , mask , out ): . ... join ( base_dir , pair_cores , mask )) . ... join ( base_dir , case , os . ... add_argument ( '--base-dir' , default = '.' , . ... add_argument ( '--pair-cores' , default = 'pair-cores' , . ... add_argument ( '--case' , default = 'case' , . ... 52 help = 'Homology from alignment (ignoring letter case)' ) . ... add_argument ( '--mask' , default = '*.xls' ,...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/file/tip/pair_cores/score-all.py -- 21.6 Кб -- 13.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
57. allpy: b556c96c6719 debian/blocks3d.install
. log . graph . tags . branches . changeset . browse . file . latest . diff . annotate . file log . raw . help . find changesets by author, revision, files, or words in the commit message . blocks3d/www Makefile: never check certificates of github, they are too confusing for wget . author . Daniil Alexeyevsky <dendik@kodomo.fbb.msu.ru> . date . Mon, 26 May 2014 17:20:29 +0400 . parents . children . line source . 1 blocks3d /* . py blocks3d /* . htm usr / share / blocks3d .
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/file/tip/debian/blocks3d.install -- 4.2 Кб -- 13.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
58. allpy: b556c96c6719 geometrical_core/spt.py
... 1 def gcs_to_spt ( spt , GCs , alignment , pdb_map ): . 2 """ Save information about geometrical cores to spt . ... 8 * pdb_map - {sequence: (chain, model)} . ... 15 spt . write ( "define p_ %(name)s *: %(chain)s / %(model)d \n " % \ . 16 { 'name' : sequence . ... append ( "core %(j)s _ %(name)s " % \ . ... 24 gc_n = [] . ... 31 batches = [] . ... 38 "define core %(j)s _ %(name)s %(batch)s and p_ %(name)s \n " % \ . ... name , 'batch' : batch , 'j' : j }) . ... 42 for batch in batches : . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/file/tip/geometrical_core/spt.py -- 18.5 Кб -- 13.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
59. allpy: repeats/repeat_joiner.py history
... Wed, 16 Feb 2011 00:01:34 +0300 . boris (kodomo) . ... Tue, 15 Feb 2011 23:44:10 +0300 . boris . repeats: fix a bug: use "is" instead of == . ... Automated merge with ssh://kodomo.fbb.msu.ru/allpy . ... Wed, 15 Dec 2010 18:30:19 +0300 . ... Sun, 28 Nov 2010 17:40:11 +0300 . ... Sat, 27 Nov 2010 22:41:18 +0300 . ... Fri, 26 Nov 2010 12:24:16 +0300 . boris (netbook) . ... Wed, 24 Nov 2010 14:57:24 +0300 . ... Tue, 23 Nov 2010 17:15:02 +0300 . ... Thu, 18 Nov 2010 23:51:20 +0300 . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/log/tip/repeats/repeat_joiner.py -- 11.6 Кб -- 13.04.2016
Похожие документы
Похожие документы
60. allpy: b556c96c6719 debian/blocks3d-wt.init
... file . ... file log . ... find changesets by author, revision, files, or words in the commit message . ... author . ... 3 ### BEGIN INIT INFO . 4 # Provides: blocks3d-wt . ... 9 # Short-Description: initialize blocks3d-wt . 10 ### END INIT INFO . ... 12 PIDDIR = /var/run/wt . ... d "$PIDDIR" ] ; then . 19 install -d -m 755 -o "$PIDOWNER" -g "$PIDGROUP" "$PIDDIR" . ... 25 echo "Usage: /etc/init.d/blocks3d-wt {start|stop}" . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/file/tip/debian/blocks3d-wt.init -- 7.1 Кб -- 13.04.2016
Похожие документы
Похожие документы